کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
505217 864484 2015 6 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Application of dual tree complex wavelet transform in tandem mass spectrometry
ترجمه فارسی عنوان
کاربرد تبدیل موجک پیچیده درخت درخت دوگانه در طیف سنجی توده ای
کلمات کلیدی
طیف سنجی جرم دو طرفه؛ پردازش داده های پروتئومیک؛ تبدیل موجک پیچیده درخت دوگانه؛ انهدام سیگنال؛ تشخیص پپتیدها
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر نرم افزارهای علوم کامپیوتر
چکیده انگلیسی


• Application of dual tree complex wavelet transform in tandem mass spectroscopy.
• New class of almost symmetric wavelet used to denoise MS/MS data.
• Results in a better detection of peptides in biological samples.

Mass Spectrometry (MS) is a widely used technique in molecular biology for high throughput identification and sequencing of peptides (and proteins). Tandem mass spectrometry (MS/MS) is a specialised mass spectrometry technique whereby the sequence of peptides can be determined. Preprocessing of the MS/MS data is indispensable before performing any statistical analysis on the data. In this work, preprocessing of MS/MS data is proposed based on the Dual Tree Complex Wavelet Transform (DTCWT) using almost symmetric Hilbert pair of wavelets. After the preprocessing step, the identification of peptides is done using the database search approach. The performance of the proposed preprocessing technique is evaluated by comparing its performance against Discrete Wavelet Transform (DWT) and Stationary Wavelet Transform (SWT). The preprocessing performed using DTCWT identified more peptides compared to DWT and SWT.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computers in Biology and Medicine - Volume 63, 1 August 2015, Pages 36–41
نویسندگان
, , , ,