کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5589928 | 1569840 | 2017 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Comparative analysis of the neurula transcriptomes of two species of flatfishes: Platichthys stellatus and Paralichthys olivaceus
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
KOGPax6BMPRTBX3FGFROPOOTX2frizzledERBBKEGG Automatic Annotation ServerWntEukaryotic Orthologous Groupsrx3Lhx2Six3sFRPTGFβRNCBI non-redundant protein sequencesorthodenticle homeobox 2NeurulamRNATGFβFGFRASNCBIMAPK - MAPKPI3K-Akt - PI3K-AKTmessenger RNA - RNA messengerBLAST, basic local alignment search tool - ابزار پایهای برای جستجوی برهم نهیهای موضعی، بلاستBlast - انفجارWingless - بی نهایتTransforming growth factor β - تبدیل فاکتور رشد βtransforming growth factor β receptor - تبدیل کننده گیرنده β عامل رشدTranscriptome - ترانسکریپتومEye development - توسعه چشمPaired box 6 - جعبه زوج 6KAAS - جگرSra - خانمflounder - خرچنگShh - خیرKEGG یا Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes - دایرة المعارف ژن ها و ژنوم کیوتو Sequence Read Archive - دنباله آرشیو را بخوانیدRIN - رینsonic hedgehog - صدای جیر جیرVascular endothelial growth factor - فاکتور رشد اندوتلیال عروقیVascular Endothelial Growth Factor (VEGF) - فاکتور رشد اندوتلیال عروقی (VEGF)fibroblast growth factor - فاکتور رشد فیبروبلاستBMP - مدیریت فرایند کسب و کارNational Center for Biotechnology Information - مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژیEye migration - مهاجرت چشمSecreted frizzled related protein - پروتئین مربوط به فروتوزاسیون ترشح می شودBone morphogenetic protein - پروتئین مورفوژنیک استخوانmitogen-activated protein kinase - پروتئین کیناز فعال با mitogenSingle nucleotide polymorphism - پلیمورفیسم تک نوکلئوتیدیSNP - چندریختی تک-نوکلئوتیدfibroblast growth factor receptor - گیرنده فاکتور رشد فیبروبلاستbone morphogenetic protein receptor - گیرنده پروتئین مورفوژنیک استخوان
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Flatfish with left-right eye asymmetry are the most significant among vertebrates. However, the genetic basis for the control of this characteristic is still unclear. We propose that the gene(s) for eye asymmetry initially control minor differences in cell number in the tissues around the eyes during eye development. This minor difference is then amplified, causing eye migration during metamorphosis. Therefore, comparing the neurula transcriptomes between flatfish species with different eye-reversal mutants may provide very useful information to screen for genes involved in eye asymmetry. In this study, two cDNA libraries constructed from neurulas of P. stellatus (high ratio of eye reversal) and P. olivaceus (very low ratio of eye reversal) were sequenced and compared. There were 8121 and 8108 unigenes annotated to 32 categories in P. stellatus and P. olivaceus, respectively, and the highest KEGG pathways in both species were 'signal transduction', 'immune system', and 'endocrine system'. In total, 62,692 and 18,938 putative single nucleotide polymorphisms (SNPs) were predicted in the P. stellatus and P. olivaceus transcriptomes, respectively. Furthermore, 8026 SNPs found in P. stellatus did not exist in P. olivaceus. Fifty-one SNPs were identified in nine genes (Fgf7, Wnt9, Sfrp2, Bmpr1B, Bmpr2, Pax3, Pax6, Six1 and Tgfβr2) related to eye development. In particular, Tgfβr2 with Asp77Glu found in P. stellatus but not in P. olivaceus will provide important information for screening genes associated with eye asymmetry.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 596, 5 January 2017, Pages 147-153
Journal: Gene - Volume 596, 5 January 2017, Pages 147-153
نویسندگان
Fen Wei, Jie Chen, Xinye Chen, Baolong Bao,