دانلود مقالات ISI درباره از مجمع جدید + ترجمه فارسی

ابزار برای ساخت مجله ترنسپکتومی دی نوو

Tools for building de novo transcriptome assembly

Keywords: از مجمع جدید; Transcriptiome; De novo assembly; Gene expression; RNA-Seq; Differential gene expression; Plant gene expression; Plant Ontology; Gene Ontology; De novo transcriptome assembly; Genome annotation; Genetic marker identification; Plant Reactome; Velvet Oases;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

چالش تشخیص هندل در ژنوم باکتریایی از داده های ترتیبی کوتاه شده

The challenge of detecting indels in bacterial genomes from short-read sequencing data

Keywords: از مجمع جدید; Indel calling; Short-read data; Bacterial genome; Structural variations; Mapping; de novo assembly;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

ژنومیک / تکنولوژی منابع توالی ترانسکتیکوم دیونه نوترکیب گونه های چند نژاد غیر مدل

Genomics/technical resourcesDe novo transcriptome sequencing of a non-model polychaete species

Keywords: از مجمع جدید; Pyrosequencing; De novo assembly; Ophryotrocha diadema; Transcriptome;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

تجزیه و تحلیل توالی چند زوج پان ژنوم و شناسایی پلی مورفیسم یکپارچگی نوکلئوتیدی مبتنی بر مرجع برای حل و فصل دو شیوع همزمان استافیلوکوکوس اورئوس در خدمات نوزادان

Pan-genome multilocus sequence typing and outbreak-specific reference-based single nucleotide polymorphism analysis to resolve two concurrent Staphylococcus aureus outbreaks in neonatal services

Keywords: از مجمع جدید; De novo assembly; multilocus sequence typing; neonatal; nosocomial outbreaks; pan-genome; single nucleotide polymorphism; spa-typing; Staphylococcus aureus; whole genome sequencing;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 22 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

پروفیل متاتراسکتکتومی یک شکوفایی جلبک دریایی

Metatranscriptome profiling of a harmful algal bloom

Keywords: از مجمع جدید; De novo assembly; Dinoflagellate; Flow cytometry; Harmful algal bloom; Metagenomics; Metatranscriptomics; Prorocentrum minimum; Transcriptomics

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

De novo assembly and annotation of the whole transcriptome of Oratosquilla oratoria

Keywords: از مجمع جدید; Oratosquilla oratoria; Transcriptome; Hiseq technology; De novo assembly; Annotation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

De novo assembly and annotation of the whole transcriptome of Sepiella maindroni

Keywords: از مجمع جدید; Sepiella maindroni; Transcriptome; RNA-seq technology; De novo assembly; Gene annotation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

De novo assembly and annotation of the Avicennia officinalis L. transcriptome

Keywords: از مجمع جدید; Avicennia officinalis; RNA-seq data; De novo assembly; Annotation; Salt glands; Candidate genes;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

Transcriptome sequencing and de novo assembly in arecanut, Areca catechu L elucidates the secondary metabolite pathway genes

Keywords: از مجمع جدید; De novo assembly; Areca genome; Flavonoids; Carotenoids;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

Transcriptome analysis for identification of candidate genes related to sex determination and growth in Charybdis japonica

Keywords: از مجمع جدید; C. japonica; Charybdis japonica; SSRs; simple sequence repeats; ORFs; open reading frames; E1; ubiquitin activating enzyme; E2; ubiquitin conjugating enzyme; E3; ubiquitin ligase; JHE; juvenile hormone esterase; STAT; signal transducer and activator of tr

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

Transcriptome analysis of Abeliophyllum distichum NAKAI reveals potential molecular markers and candidate genes involved in anthocyanin biosynthesis pathway

Keywords: از مجمع جدید; Abeliophyllum distichum; RNA-seq; De novo assembly; Anthocyanin; Antioxidant;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

Comprehensive inbred variation discovery in Bama pigs using de novo assemblies

Keywords: از مجمع جدید; BX pig; Bama Xiang pig; BM pig; Bama mini-pig; SNP; single nucleotide polymorphism; Indel; insertion and deletion; SV; structural variation; CNV; copy number variation; GO; Gene Ontology; KEGG; Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes; ADGRE2; adhesion G p

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

Transcriptome analysis reveals interplay between hormones, ROS metabolism and cell wall biosynthesis for drought-induced root growth in wheat

Keywords: از مجمع جدید; Auxin; Cell wall; De novo assembly; Ethylene; Root growth; Total root length;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

Chloroplast phylogeography of AA genome rice species

Keywords: از مجمع جدید; Asian wild rice; Chloroplast sequence; Phylogenetic analysis; OryzaAA genome; De novo assembly; Mapping assembly;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

De-novo assembly and transcriptome analysis of Odontesthes argentinensis gill tissue, with development of single sequence repeat markers

Keywords: از مجمع جدید; BLAST; Basic Local Alignment Search Tool; bp; base pair(s); CDS; coding sequence; cDNA; DNA complementary to RNA; GO; Gene Ontology; INDEL; insertion or deletion of bases; KEGG; Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes; mRNA; messenger RNA; UTR; untranslat

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 43 صفحه سال انتشار : 2018 سفارش ترجمه

De novo transcriptome assembly of the hydrocoral Millepora alcicornis (branching fire coral) from the Caribbean

Keywords: از مجمع جدید; Transcriptome; De novo assembly; Puerto Rico; Coral; Hydrozoan; Hydrocoral;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Extensive genetic diversity among populations of the malaria mosquito Anopheles moucheti revealed by population genomics

Keywords: از مجمع جدید; Anopheles moucheti; Population genomics; RADseq; De novo assembly;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

De novo assembly of the ringed seal (Pusa hispida) blubber transcriptome: A tool that enables identification of molecular health indicators associated with PCB exposure

Keywords: از مجمع جدید; Transcriptome; de novo assembly; Pinniped; Ringed seal; Polychlorinated biphenyls; RNA-seq;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 10 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Transcriptional response of the harmful raphidophyte Heterosigma akashiwo to nitrate and phosphate stress

Keywords: از مجمع جدید; Heterosigma akashiwo; Harmful algal bloom; Phytoplankton; De novo assembly; Gene expression; Transcriptome;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

PECC: Correcting contigs based on paired-end read distribution

Keywords: از مجمع جدید; Next generation sequencing; De novo assembly; Contigs; Paired-end reads;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 14 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Reducing the number of artifactual repeats in de novo assembly of RNA-Seq data by optimizing the assembly pipeline

Keywords: از مجمع جدید; BUSCOs; Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs; CC; untreated G. changii; CT; sulfate-deprivated G. changii; DEGs; differentially expressed genes; PCR; polymerase chain reaction; ST; SOAPdenovo-Trans‑TGICL; TGICL; The Gene Index Clustering Tool; T

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 22 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

Discovery and metagenomic analysis of an anammox bacterial enrichment related to Candidatus “Brocadia caroliniensis” in a full-scale glycerol-fed nitritation-denitritation separate centrate treatment process

Keywords: از مجمع جدید; Anammox; Metagenomics; Next generation sequencing; de novo assembly; Candidatus “Brocadia caroliniensis”;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 29 صفحه سال انتشار : 2017 سفارش ترجمه

De novo assembly of the transcriptome of Aegiceras corniculatum, a mangrove species in the Indo-West Pacific region

Keywords: از مجمع جدید; Mangrove; Transcriptome; Sequencing; De novo assembly; Annotation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

A transcriptome resource for the Antarctic pteropod Limacina helicina antarctica

Keywords: از مجمع جدید; Southern Ocean; RNA sequencing; De novo assembly; Ocean acidification; Ocean warming;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

V-GAP: Viral genome assembly pipeline

Keywords: از مجمع جدید; NGS; next-generation sequencing; Next-generation sequencing; De novo assembly; Shotgun sequences; Virus genomes;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Effective de novo assembly of fish genome using haploid larvae

Keywords: از مجمع جدید; NGS; next-generation sequencing; OLC; overlap-layout-consensus; DBG; de Bruijn graph; SNPs; single nucleotide polymorphisms; Ns; unassigned nucleotides; Haploid larvae; De novo assembly; Fish genome; Yellowtail; Allelic variation; Ion proton sequencer;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

The testes transcriptome of the New World Screwworm, Cochliomyia hominivorax

Keywords: از مجمع جدید; New World Screwworm; Transcriptome; Testes; RNA-seq; de novo assembly;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 6 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Multiplexed next-generation sequencing and de novo assembly to obtain near full-length HIV-1 genome from plasma virus

Keywords: از مجمع جدید; HIV-NFLG; De novo assembly; Plasma;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 7 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Comparing de novo and reference-based transcriptome assembly strategies by applying them to the blood-sucking bug Rhodnius prolixus

Keywords: از مجمع جدید; Rhodnius prolixus; Chagas disease vectors; Reference transcriptome; de novo assembly; Referenced-based assembly; OBP; CSP;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

De novo assembly and transcriptome characterization of major growth-related genes in various tissues of Penaeus monodon

Keywords: از مجمع جدید; De novo assembly; Transcriptome analysis; Growth-related genes; Next-generation sequencing; Penaeus monodon;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

A transcriptome study on Macrobrachium rosenbergii hepatopancreas experimentally challenged with white spot syndrome virus (WSSV)

Keywords: از مجمع جدید; Transcriptomics; Macrobrachium rosenbergii; WSSV; De novo assembly; Immune genes; Host–pathogen interaction

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 13 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

De novo annotation of the immune-enriched transcriptome provides insights into immune system genes of Chinese sturgeon (Acipenser sinensis)

Keywords: از مجمع جدید; Chinese sturgeon (Acipenser sinensis); Transcriptome; De novo assembly; Immune-related gene; Microsatellites

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 18 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Mitogenomics of Hesperelaea, an extinct genus of Oleaceae

Keywords: از مجمع جدید; bp; base pair; dN; non-synonymous substitution rate; dS; synonymous substitution rate; GC content; Guanine and Cytosine content; GTR + G; General Time Reversible + Gamma; mitogenome; mitochondrial genome; NGS; Next Generation Sequencing; plastome; pla

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 19 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

De novo sequencing and transcriptome analysis of female venom glands of ectoparasitoid Bracon hebetor (Say.) (Hymenoptera: Braconidae)

Keywords: از مجمع جدید; De novo assembly; Next generation sequencing; Illumina technology; RNA-seq; Bracon hebetor; Transcriptome; Venom glands;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 28 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

De novo sequencing and transcriptome analysis of venom glands of endoparasitoid Aenasius arizonensis (Girault) (=Aenasius bambawalei Hayat) (Hymenoptera, Encyrtidae)

Keywords: از مجمع جدید; De novo assembly; Illumina technology; RNA-seq; Transcriptome; Venom glands; Aenasius arizonensis.; RNA-seq; Ribonucleic Nucleic Acid: sequencing; mRNA; messenger RNA; ORF; open reading frame; RT-PCR; reverse transcription polymerase chain reaction; NCBI;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 33 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

Oxford Nanopore MinION Sequencing and Genome Assembly

Keywords: از مجمع جدید; Third-generation sequencing; Oxford nanopore MinION device; De novo assembly; Structural variations; Molecular clinical diagnostics;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 37 صفحه سال انتشار : 2016 سفارش ترجمه

De novo assembly of the transcriptomes of two yellow mangroves, Ceriops tagal and C. zippeliana, and one of their terrestrial relatives, Pellacalyx yunnanensis

Keywords: از مجمع جدید; Ceriops; Transcriptome; Sequencing; De novo assembly; Annotation;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

De novo sequencing and characterization of the Bradysia odoriphaga (Diptera: Sciaridae) larval transcriptome

Keywords: از مجمع جدید; Bradysia odoriphaga; De novo assembly; Functional annotation; Next generation sequencing; Transcriptome;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 8 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Comparative genome analysis of Lysinibacillus B1-CDA, a bacterium that accumulates arsenics

Keywords: از مجمع جدید; Toxic metals; Bioremediation; Lysinibacillus sphaericus B1-CDA; Genome sequencing; de novo assembly; Gene prediction

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Integrated modeling of protein-coding genes in the Manduca sexta genome using RNA-Seq data from the biochemical model insect

Keywords: از مجمع جدید; Gene annotation; de novo assembly; Tobacco hornworm; Automated gene modeling; Arthropod genomicsOGS, official gene set; ORF, open reading frame; L, length; ML, match length; QL, query length; SL, subject length; M, MAKER; C, Cufflinks; T, Trinity; O, Oase

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Generation and analysis of expressed sequence tags (ESTs) of Camelina sativa to mine drought stress-responsive genes

Keywords: از مجمع جدید; Camelina sativa; Drought tolerance; EST; False flax; Marker; De novo assembly; SSR; BiofuelEST, Expressed Sequence Tag; BLAST, Basic Local Alignment Search Tool; COG, Clusters of Orthologous Groups; GO, gene ontology; KEGG, Kyoto Encyclopedia of Genes and

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

PacBio Sequencing and Its Applications

Keywords: از مجمع جدید; Third-generation sequencing; De novo assembly; Gene isoform detection; Methylation; Hybrid sequencing

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 12 صفحه سال انتشار : 2015 سفارش ترجمه

Establishment of a comprehensive reference transcriptome for vertebral bone tissue to study the impacts of nutritional phosphorus deficiency in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum)

Keywords: از مجمع جدید; Transcriptome; RNA-sequencing; De novo assembly; Bone and cartilage; Phosphorus; Oncorhynchus mykiss;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 4 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Transcriptome profiling and comparative analysis of Panax ginseng adventitious roots

Keywords: از مجمع جدید; adventitious root; de novo assembly; next-generation sequencing; Panax ginseng; transcriptome

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 11 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

454 pyrosequencing-based analysis of gene expression profiles in the amphipod Melita plumulosa: Transcriptome assembly and toxicant induced changes

Keywords: از مجمع جدید; De novo assembly; Transcriptome assembly; RNA Seq; Amphipod; Toxicogenomics

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2014 سفارش ترجمه

Combination of de novo assembly of massive sequencing reads with classical repeat prediction improves identification of repetitive sequences in Schistosoma mansoni

Keywords: از مجمع جدید; Schistosoma mansoni; Repetitive sequences; Massive sequencing; de novo Assembly;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 5 صفحه سال انتشار : 2012 سفارش ترجمه

The limitations of draft assemblies for understanding prokaryotic adaptation and evolution

Keywords: از مجمع جدید; Transposable elements; Next-generation sequencing; Cupriavidus metallidurans CH34; Genomic islands; De novo assembly;

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2012 سفارش ترجمه

Isolation and molecular characterization of a second serotype of the encephalomyocarditis virus

Keywords: از مجمع جدید; Next generation sequencing; De novo assembly; Antigenic site; Picornavirus; Cardiovirus; Phylogenetic analysis

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 9 صفحه سال انتشار : 2012 سفارش ترجمه

Review of General Algorithmic Features for Genome Assemblers for Next Generation Sequencers

Keywords: از مجمع جدید; Genome assembly; Next-generation sequencing; Comparative assembly; de novo assembly; de Bruijn graphs

دانلود رایگان متن کامل مقاله ISI 16 صفحه سال انتشار : 2012 سفارش ترجمه