Biologie synthétique et intégrative

RésuméLa biologie systémique permet d’explorer analytiquement la logique du vivant, cependant que la biologie de synthèse l’exploite dans une perspective ingénieurale. Pour autant, la capacité de la biologie de synthèse à faire progresser les connaissances les plus fondamentales ne doit pas être négligée, lorsque par exemple il s’agit de distinguer entre les hypothèses de contingence ou de contrainte physicochimique pour expliquer l’universalité d’un phénomène. Une question difficile est de réussir le passage efficace de l’analyse à la synthèse. Nous avons testé ce passage dans le cadre d’une modeste équipe. Nous avons observé l’existence d’un schéma global des régulations transcriptionnelles dans les microorganismes. Il est implémenté par une périodicité des gènes co-régulés, le long du chromosome. Or ces résultats faisant appel à la biologie systémique suggèrent une stratégie biomimétique pour la co-régulation de nombreux gènes impliqués, par exemple, dans un circuit métabolique dessiné par l’ingénieur.

Systems biology allows one to explore life's design principles, whereas synthetic biology exploits these principles from an engineering perspective. For all that, the capacity of synthetic biology to make progress in the most fundamental areas of knowledge must not be neglected, when, for example, it concerns distinguishing between contingency hypotheses, or physicochemical constraint hypotheses to explain the universality of a phenomenon. A difficult question is the efficient passage from analysis to synthesis. We have tested this passage in our small team, looking at the existence of a global scheme for transcriptional regulation in organisms. However, these results, using systems biology, suggest a biomimetic strategy for the co-regulation of numerous genes involved, for example, in a metabolic circuit designed by an engineer.