NMR identification of ligands of aminoglycoside resistance enzymes

Bacterial resistance to aminoglycosides is mainly the result of enzyme-catalyzed chemical modifications of these antibiotics, which prevents their binding to their target. In order to circumvent this mechanism, an attractive possibility would be to block these enzymes, using selective inhibitors. This work describes a rational strategy aimed at isolating specific ligands of these enzymes, using NMR spectroscopy. Using magnetization transfer techniques, the identification of contacts between elementary pharmacophores and the protein target allows the guidance of hit improvement from a very early stage. To cite this article: F. Maurice et al., C. R. Chimie 9 (2006).

RésuméLa résistance bactérienne aux aminoglycosides est principalement la conséquence de l'action d'enzymes qui modifient chimiquement ces antibiotiques et les empêchent ainsi de se lier à leur cible. Pour contourner ce mécanisme, une possibilité intéressante consisterait à bloquer l'action de ces enzymes au moyen d'inhibiteurs sélectifs. Nous décrivons une approche rationnelle utilisant la spectroscopie RMN pour isoler des ligands spécifiques de ces enzymes. En utilisant des techniques de transfert d'aimantation, l'identification de contacts entre des pharmacophores élémentaires et la cible protéique permet de guider de manière précoce le processus d'amélioration des touches obtenues. Pour citer cet article : F. Maurice et al., C. R. Chimie 9 (2006).