Profil d’expression génétique prédictif de la réponse aux anti-TNF chez les patients atteints d’une polyarthrite rhumatoïde : analyse des données GEO

RésuméObjectifsLes anti-tumor necrosis factor (TNF) sont des traitements de choix dans la polyarthrite rhumatoïde (PR) ne répondant pas aux disease-modifying anti-rheumatic drugs. Cependant, une proportion importante de patients traités par anti-TNF ne présente pas de réponse clinique adéquate. De ce fait, il paraît nécessaire d’établir des biomarqueurs prédisant la réponse aux anti-TNF. Récemment, le profil d’expression génétique avait été appliqué en recherche afin de développer de tels biomarqueurs.MéthodesNous avons comparé les profils d’expression génétiques rapportés dans les précédentes études, traitant de la réponse aux anti-TNF chez les patients atteints de PR et ne répondant pas aux anti-TNF. Nous avons utilisé les données des biopuces disponibles dans le Gene Expression Omnibus (GEO) du Centre national de l’information en biotechnologie (NCBI).RésultatsCette analyse avait inclus 6 études et 5 groupes de données de biopuces qui étaient utilisées sur des échantillons sanguins périphériques pour identifier les DEGs prédisant la réponse aux anti-TNF. Nous avons retrouvé un chevauchement entre les différences d’expression des gènes (DEGs) que nous avons bien cotés dans chaque étude. Trois DEGs incluant l’IL2RB, SH2D2A et G0S2 sont apparus dans plus d’une étude. De plus, une méta-analyse destinée à augmenter la puissance statistique avait retrouvé un seul DEG, G0S2 par la méthode de Fisher.ConclusionNos données suggèrent la possibilité que le G0S2 joue un rôle prédictif de réponse au traitement par anti-TNF chez les patients atteints de polyarthrite rhumatoïde. D’autres explorations basées sur des études plus larges sont nécessaires afin de confirmer la signification de G0S2 dans la prédiction de la réponse aux anti-TNF.