Prévalence de Candida parapsilosis, C. orthopsilosis et de C. metapsilosis au sein des candidémies au CHU de Nantes et profil de sensibilité aux échinocandines par la méthode E-test® : étude rétrospective de cinq ans (2004–2009)

RésuméBut de l’étudeDéterminer la prévalence de C. parapsilosis sensu stricto, C. orthopsilosis et de C. metapsilosis dans les candidémies au CHU de Nantes et évaluer la sensibilité in vitro des isolats vis-à-vis des trois échinocandines (caspofungine, micafungine et anidulafungine).Matériel et méthodesÉtude rétrospective (mars 2004 à juillet 2009) de 178 épisodes de candidémies correspondant à 183 isolats de Candida spp. identifiées par les méthodes traditionnelles phénotypiques. Identification rétrospective des isolats de C. parapsilosis par analyse des régions ITS. Détermination des concentrations minimales inhibitrices par E-test®. Recherche de mutations associées à la résistance sur le gène FKS1 chez toutes les souches non sensibles (concentrations minimales inhibitrices [CMI] > 2 μg/mL).RésultatsDurant la période de l’étude, C. parapsilosis sensu lato a été responsable de 27 épisodes de candidémies au second rang après C. albicans en termes de fréquence (n = 99, 54,1 %). Aucun C. orthopsilosis ni C. metapsilosis n’a été identifié à l’issue de l’analyse moléculaire. Conformément à la littérature, tous les isolats présentaient des CMI relativement élevées vis-à-vis des échinocandines. Toutefois, l’ensemble des isolats restaient sensibles à la caspofungine et à la micafungine (CMI ≤ 2 μg/mL), avec une bonne concordance des résultats entre 24 heures et 48 heures (CMI50 = 0,75 μg/mL, CMI90 = 1,5 μg/mL). Quatorze isolats, sensibles à l’anidulafungine à 24 heures (CMI50 = 1 μg/mL, CMI90 = 1,5 μg/mL) apparaissaient non sensibles à 48 heures (CMI50 = 3 μg/mL, CMI90 = 12 μg/mL) malgré l’absence de mutation associée à la résistance.ConclusionNous confirmons la faible prévalence de C. orthopsilosis et C. metapsilosis dans les candidémies au CHU de Nantes. Les difficultés d’interprétation des CMI par la méthode E-test® sont discutées.

Aim of the studyTo determine the prevalence of C. parapsilosis sensu stricto, C. orthopsilosis and C. metapsilosis among candidemia at Nantes University Hospital and to evaluate the in vitro susceptibility of the isolates against three echinocandin drugs (caspofungin, micafungin and anidulafungin).Material and methodsRetrospective study (march 2004 to july 2009) of 178 cases of candidemia corresponding to 183 Candida spp. strains identified by means of routine phenotypical methods. Re-identification of C. parapsilosis sensu lato isolates was performed by ITS rDNA sequencing analysis. Minimal inhibitory concentrations (MIC) were determined by E-test®. All echinocandin non-susceptible isolates (MIC > 2 μg/mL) were analyzed for the presence/absence of FKS1 mutations associated with resistance.ResultsDuring this period, C. parapsilosis sensu lato was responsible for 27 candidemia, ranging at the second most common Candida species after C. albicans (n = 99, 54.1%). Neither isolates belong to C. orthopsilosis nor C. metapsilosis. According to the literature, all the isolates displayed high MICs against the three echinocandin drugs. All the isolates displayed both susceptibility (MIC ≤ 2 μg/mL) and a good agreement between MICs read at 24 h and 48 h for caspofungin and micafungin (MIC50 = 0.75 μg/mL, MIC90 = 1.5 μg/mL). Surprisingly, whereas most of the strains were susceptible to anidulafungin at 24 h (MIC50 = 1 μg/mL, MIC90 = 1.5 μg/mL), 14 (52 %) displayed non-susceptibility, despite the lack of mutation associated with resistance on FKS1, when reading was performed at 48 h (MIC50 = 3 μg/mL, MIC90 = 12 μg/mL).ConclusionPrevalence of C. orthopsilosis and C. metapsilosis in patients with candidemia is low at Nantes University Hospital. The difficulty encountered with MIC reading by E-test® are discussed.