Comparaison de quatre paires d’amorces différentes dans la détection d’Helicobacter pylori dans les biopsies gastriques et les prélèvements oraux

RésuméObjectifsLa présence d’Helicobacter pylori (H. pylori) dans la cavité orale est très controversée et la méthode appropriée pour la détection d’H. pylori dans les prélèvements oraux reste à établir. L’objectif de cette étude est de comparer quatre paires d’amorces différentes pour la détection d’H. pylori dans les biopsies gastriques et les prélèvements oraux en utilisant la PCR en temps réel.Matériel et méthodeDes biopsies gastriques et des prélèvements oraux sont collectés chez huit sujets présentant une gastrite. L’ADN des échantillons cliniques est extrait et analysé pour la détection d’H. pylori par PCR en temps réel (LightCycler®2.0) en utilisant quatre paires d’amorces différentes qui ciblent le gène 16SrRNA (16S rRNA#295 ; 16S rRNA#120) ou glmM (glmM#294 ; glmM#722). Trois souches de référence d’H. pylori et trois souches cliniques ont servi de référence. La spécificité des quatre paires d’amorces a été examinée en analysant sept micro-organismes oraux et deux espèces d’Helicobacter non pylori.RésultatsLa paire d’amorces 16S rRNA#120 a montré une spécificité acceptable et une haute sensibilité. Les paires d’amorces glmM#294 et glmM#722 ont montré une haute spécificité mais une sensibilité basse. La paire d’amorces 16S rRNA#295 a démontré une spécificité faible mais une sensibilité acceptable. Quatre biopsies gastriques sont positives à H. pylori par la culture, l’histologie et la PCR en temps réel en utilisant la paire d’amorces 16S rRNA#295 ou 16S rRNA#120. Aucun ADN d’H. pylori n’a été détecté dans les échantillons oraux ni par la culture ni par la PCR en temps réel.ConclusionDes quatre paires d’amorces testées, la 16S rRNA#120 semble être la plus appropriée pour la détection d’H. pylori dans les prélèvements cliniques en utilisant la PCR en temps réel.

AimsThe presence of Helicobacter pylori. in the oral cavity remains controversial and the most appropriate method for detection of oral H. pylori has yet to be established. The aim of the present study was to compare four different primer sets on the detection of H. pylori in gastric biopsies and oral samples using real-time PCR.Material and methodsGastric biopsy and oral samples were collected from eight patients with gastric symptoms. DNA from clinical samples was extracted and analyzed for the presence of H. pylori by real-time PCR (LightCycler®2.0) using four pairs of primers which targeted 16S rRNA (16S rRNA#295; 16S rRNA#120) or glmM (glmM#294; glmM#722) DNA genes. Three H. pylori strains and three clinical isolates served as reference. The specificities of the four primer pairs were examined for seven oral microorganisms and two Helicobacter non-pylori species.ResultsPrimer pair 16S rRNA#120 showed an acceptable specificity and a high sensitivity. Primer pairs glmM#294 and glmM#722 demonstrated a high specificity but a low sensitivity and primer pair 16S rRNA#295 demonstrated a poor specificity but acceptable sensitivity. Four H. pylori positive gastric biopsies were demonstrated by culture, histology and real-time PCR with primer pairs 16S rRNA#295 or 16S rRNA#120. No H. pylori was detected in oral samples, either by culture or by real-time PCR.ConclusionOf the four different primer pairs examined, 16S rRNA#120 was the most appropriate to detect H. pylori in clinical samples using real-time PCR.