Étude des populations staphylococciques hospitalières : apport des techniques récentes de biologie moléculaire

RésuméBut de l'étudeL'objectif de cette étude est de déterminer l'origine des souches de Staphylococcus aureus acquises en portage et en infection par les patients hospitalisés. En particulier, nous souhaitons évaluer l'existence et l'intensité de la transmission entre les personnels soignants et les patients hospitalisés.Patients et méthodesUne enquête prospective d'une durée de deux mois a été menée au sein de services à risque : réanimation, dermatologie, pathologie infectieuse et tropicale et médecine interne. Les souches bactériennes ont été isolées par écouvillonnage nasal des patients et personnels soignants. Leur comparaison a été réalisée grâce à leur phénotype de résistance aux bêtalactamines et par biologie moléculaire. La technique de typage utilisée est récente. Il s'agit du MLVA (multi locus variable number of tandem repeat). Elle n'a jamais été utilisée dans ce contexte.RésultatsCent cinquante-sept souches de S. aureus ont été obtenues. Leur comparaison a nécessité la réalisation de 1900 PCR environ (et autant de migration en gel d'agarose), le tout réalisé sur une durée de dix jours. Elle nous a permis de mettre en évidence l'existence d'un clone prédominant en portage chez les patients mais également en acquisition durant l'hospitalisation. Il se rapproche du clone hospitalier V (Méti-R Genta-S agr 1) décrit, par ailleurs, avec d'autres techniques de typage. Cette étude a aussi montré l'existence d'une transmission personnel soignant–patient (et inversement) et ce, en dehors de tout phénomène épidémique.ConclusionLes résultats obtenus sont quantitativement insuffisants pour décider de mettre en place une politique de lutte basée sur le dépistage des personnels soignants. En revanche, cette étude nous a permis de vérifier que le MLVA pouvait être un outil d'usage courant pour les équipes opérationnelles d'hygiène du fait de son pouvoir discriminant, de la pertinence des données qu'il fournit et de sa rapidité d'emploi.

ObjectivesTo determinate the origin of acquired S. aureus among hospitalised patients and to evaluate the transmission of strains between health care workers and hopistalised patients.MethodsThe method chosen is a prospective study in risky clinical yards. Nasal swabing of patients and health care workers has been done to isolate bacterial samples. Caracterisation and comparaison of bacterial strains have been made using their antibiotic resistance profil and a recent molecular genotyping technic named MLVA (Multi Locus Variable Number of Tandem Repeat). It has never been used in such context.RésultsOne hundred and fifty-seven strains have been isolated. They have been compared while realizing 1900 PCR and agar gel electrophoresis in 10 days. 15 clones were identified. One of them is mainly represented among patient's nasal carriage and acquired strains. As far as antibiotype and agr type are concerned, it is similar to hospital-acquired clone described in Europe with other technics (MRSA, Gentamicine-S agr 1). This clone appears to be also transmitted between health care workers and patients.ConclusionAlthough it exists, we can't appreciate the intensity of this transmission. These results don't allow us to proceed to a systematic screening for nasal carriage among our health care workers. This study shows that MLVA could be a reliable molecular typing method, which could be used in every day practice. In our experience, it is as performing as PFGE, more didactic, faster and easier.