Caractérisation phénotypique et génotypique (randomly amplified polymorphic DNA analysis et multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis) de 96 isolats cliniques de Pseudomonas aeruginosa à l’hôpital F. Bourguiba (Monastir, Tunisie)

RésuméBut de l’étudeCaractérisation phénotypique et génotypique de 96 isolats cliniques de Pseudomonas aeruginosa dans un hôpital universitaire tunisien sur une période de 16 mois.Matériels et méthodesTous les isolats ont été caractérisés par sérotypie et antibiotypie, puis génotypés par deux techniques : randomly amplified polymorphic DNA analysis (RAPD) et multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA).RésultatsQuarante et un isolats sur 96 (43 %) provenaient de deux unités de soins intensifs (médicale et chirurgicale). La plupart (48 %) étaient de sérotype O:11. Parmi les 13 antibiotypies, trois, multirésistants aux antibiotiques, ont été le plus souvent observés dans les deux unités de soins intensifs. La génotypie a montré 83 types par RAPD et 52 types par MLVA. Des isolats de même sérotype pouvaient présenter des génotypes différents. Un nombre limité de cas groupés a été mis en évidence par typage MLVA, dont une épidémie de neuf cas dans l’unité de soins intensifs de chirurgie.ConclusionHormis cette épidémie de neuf cas, l’hétérogénéité observée pour la majorité des isolats de P. aeruginosa a montré que les situations épidémiques étaient rares à l’hôpital F. Bourguiba pendant la période de l’étude. La technique MLVA est un bon outil pour génotyper les isolats cliniques de P. aeruginosa.

Aim of the studyPhenotypic and genotypic characterization of 96 clinical isolates of Pseudomonas aeruginosa recovered in a Tunisian teaching hospital during a 16-month period.Materials and methodsAll the isolates were characterized by serotyping, antimicrobial susceptibility typing and genotyping with randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis and multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA).ResultsForty-one isolates out of 96 (43%) were recovered from two intensive care units (medical and chirurgical). Most of the isolates (48%) belonged to serotype O:11. Among the 13 antibiotypes, three multidrug resistant ones were mostly observed within the two intensive care units. Genotyping showed 83 RAPD types and 52 MLVA types. Isolates showing the same serotype could show different genotypes. A limited number of clusters was highlighted with MLVA typing, of which an outbreak of nine cases within the surgical intensive care unit.ConclusionExcept this outbreak of nine cases, the heterogeneity observed for most of the P. aeruginosa isolates showed that outbreak situations were rare in the F. Bourguiba hospital during the study period. MLVA genotyping is a good tool for genotyping P. aeruginosa clinical isolates.