Apport de la détection des mycobactéries du complexe tuberculosis par PCR dans des prélèvements pulmonaires et extrapulmonaires

RésuméBut de l'étudeÉvaluer la sensibilité de la PCR par rapport à la culture des mycobactéries du complexe tuberculosis et déterminer le délai entre le résultat de la PCR et celui de l'identification des mycobactéries en culture.Matériel et méthodesQuatre-vingt-dix-neuf prélèvements pulmonaires et 66 prélèvements extrapulmonaires sont analysés. Les échantillons sont ensemencés en milieu liquide (MGIT, Bactec 960) et solide (Coletsos) et incubés respectivement 6 et 12 semaines. L'identification est réalisée par PCR suivie d'une hybridation à des sondes ADN sur bandelette (Génotype MTBC, HAIN). La détection d'ADN directement sur le prélèvement est réalisée par PCR (Cobas Amplicor Mycobacterium tuberculosis test, Roche).RésultatsLa sensibilité de la PCR est de 100 % pour les prélèvements pulmonaires (50/50) et extrapulmonaires (7/7) présentant des BAAR à l'examen direct (M+). Le délai entre le résultat de la PCR et l'identification est de 11 jours pour les prélèvements pulmonaires et de huit jours pour les prélèvements extrapulmonaires M+. La sensibilité de la PCR des prélèvements ne présentant pas de BAAR à l'examen direct (M–) est, respectivement, de 78,7 % (37/47) et 51,8 % (29/56) pour les prélèvements pulmonaires et extrapulmonaires. En cas de résultat positif de la PCR des prélèvements M–, un gain de 13 jours pour les prélèvements pulmonaires et de 12 jours pour les prélèvements extrapulmonaires est obtenu par rapport à l'identification.ConclusionUn résultat positif de la PCR sur un prélèvement pulmonaire permet un gain de 11 à 13 jours dans le diagnostic.

Aim of the studyTo evaluate the sensitivity of PCR versus culture of complex tuberculosis mycobacteria and to determine the delay between PCR results and identification of mycobacteria in culture.Materials and methodsNinety-nine pulmonary and 66 extrapulmonary specimens were analyzed. Samples were inoculated on liquid (MGIT, Bactec) and solid media (Coletsos) and respectively incubated 6 and 12 weeks. Identification was performed by reverse hybridization of PCR products to their complementary probes immobilized on membrane strips (Genotype MTBC, HAIN). Specimens DNA detection was realized by PCR (Cobas Amplicor Mycobacterium tuberculosis test, Roche).ResultsSensitivity of PCR for acid fast bacilli smear positive pulmonary (50/50) and extrapulmonary (7/7) specimens was 100%. Delay between PCR result and identification was 11 days for pulmonary specimens and 8 days for extrapulmonary specimens. Sensitivity of PCR for smear negative samples was, respectively, of 78.7% (37/47) and 51.8% (29/56) for pulmonary and extrapulmonary specimens. In case of PCR positive result of a smear negative sample, a gap of respectively 13 and 12 days was obtained for pulmonary and extrapulmonary specimens compared to identification.ConclusionPositive PCR result for respiratory specimens allows a gap of 11 to 13 days in diagnosis in comparison with identification of mycobacteria in culture.