Protéomique et marqueurs cardiaques

RésuméLes maladies cardiovasculaires sont les causes majeures de la mortalité et de la morbidité dans les pays développés et les mécanismes moléculaires responsables sont encore largement inconnus bien que l’expression de certain(e)s gènes/protéines soit altérés. La complexité biologique a mis en évidence le fait qu’un gène ne code pas pour une seule protéine mais pour plusieurs à cause des différents processus d’épissage alternatif, des modifications post-traductionnelles. L’analyse protéomique est une technologie qui permet d’appréhender de manière globale les modulations du niveau d’expression des protéines et d’effectuer une comparaison différentielle entre divers échantillons. L’analyse en surface-enhanced laser desorption ionization–time of flight (SELDI–TOF) est une technique, basée sur la combinaison de la chromatographie par rétention sur des puces à protéine et la spectrométrie de masse, qui permet la comparaison de profils protéiques à partir d’échantillons biologiques variés. Cette technique a été particulièrement utilisée pour l’étude du plasma/sérum. Nous aborderons l’analyse protéomique comparative du plasma de patients ayant eu un infarctus par la technique SELDI en abordant le principe de cette technique, les problèmes inhérents à l’étude du plasma, l’identification des protéines et la validation de l’approche en utilisant d’autres techniques. Ces approches se révèlent particulièrement intéressantes pour étudier les maladies cardiovasculaires dans le but de comprendre les mécanismes moléculaires impliqués, pour mettre en évidence les interactions protéiques et identifier de nouveaux facteurs/marqueurs biologiques impliqués dans les différentes pathologies cardiovasculaires.

Cardiovascular diseases are the major causes of morbidity and mortality in western countries and the molecular mechanisms responsible are greatly unknown unless a genetic defect or genes/proteins alteration. The biological complexity has shown that one gene did not encode for one protein but for several, due to mRNA splicing and post-translational modifications. Proteomic analysis is a technology that can provide a global approach to study protein modulation and study by differential comparison various samples. Surface-enhanced laser desorption ionization–time of flight (SELDI–TOF) analysis is a technique, based on combination of chromatography of proteins on proteinchip arrays and mass spectrometry, allowing the comparison of protein profiles from various biological samples. This technology has been particularly used for plasma/serum analysis. We will take, as example, the comparative proteomic analysis of plasma from patients having a myocardial infarction by the SELDI approach in describing the principle, the problems linked to the study of plasma, the protein identification and the validation of the technology using other techniques. These approaches have been proved to be interesting for studying cardiovascular diseases in order to better understand the molecular mechanisms involved and identifying protein interactions and new biological factors/biomarkers involved in cardiovascular.