Technique d'analyse des courbes de fusion haute résolution (FHR) ou High Resolution Melting analysis (HRM) en infectiologie

L'analyse en High Resolution Melting (HRM), bien utilisée en recherche fondamentale, commence à trouver des applications pratiques, comme en onco-hématologie, dans la détection et la quantification de mutations, permettant de distinguer la monoclonalité de la polyclonalité dans les lymphomes non-hodgkiniens ou les mutations des gènes NMP1 ou FLT3 dans les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) ou les mutations des gènes MPL et de l'hexon 12 de JAK2 dans les syndromes myéloprolifératifs. En infectiologie, les publications datent de trois ans seulement, et ont pour but soit d'identifier les levures, virus ou bactéries, soit de différencier dans un but épidémiologique les différentes souches virales ou bactériennes ou encore les souches sauvages des souches vaccinales, soit de mettre en évidence des mutations portant sur des gènes de résistance, comme la résistance à la rifampicine chez Mycobacterium tuberculosis. Cette technique simple, rapide (moins de deux heures) réduit considérablement le coût mais aussi le temps nécessaire à l'étude de la variabilité des gènes. N'utilisant pas de sondes spécifiques, le coût de l'analyse est encore diminué d'autant plus que le recours au séquençage ou à la DHPLC (chromatographie liquide à haute pression en condition dénaturante) est moins fréquent. Dans cet article, après avoir décrit brièvement la technique HRM, nous nous attacherons à exposer ses diverses applications.