A new genetic test for the rapid identification of shiga-toxines producing (STEC), enteropathogenic (EPEC) E. coli isolates from children

Les techniques de routine utilisées dans les laboratoires de bactériologie médicale ne permettent pas de détecter les E. coli pathogènes des diarrhées infantiles, notamment les E. coli enteropathogènes (EPEC) et shigatoxinogènes ou enterohémorragiques (STEC/EHEC). En raison de l'absence de corrélation entre sérotype et pathotype, il est nécessaire d'utiliser une technique génétique d'identification. Nous avons évalué le test Genotype® EHEC (Hain Life Science, Germany), un nouveau système fondé sur l'amplification génique suivie d'une hybridation permettant de détecter les gènes stx1 et stx2 des shigatoxines, le gène eae de l'intime et le gène ipaH trouvé chez les E. coli enteroinvasif (EIEC) et les Shigella. Des souches d'E. coli de différents sérogroupes isolés chez des enfants présentant une gastro-entérite aiguë, une colite hémorragique ou un syndrome hémolytique urémique ont été testées avec le test Genotype® EHEC (Hain Life Science, Germany). La collection de souches comprenait onze STEC/EHEC (de sérogroupe O26, O157, O111, O91, O-nontypé) et neuf EPEC (de sérogroupe O26, O157, O55, O126, O127, O-nontypé) ; leur génotype avait été préalablement déterminé par PCR « maison » standard. Pour toutes les souches le profil de virulence obtenu avec le test Genotype® EHEC correspondait à celui attendu. Le test Genotype® EHEC ne requiert aucun équipement spécial et présente les avantages d'une révélation sans système électrophorétique, sans coloration au bromure d'éthidium et sans système d'imagerie. De plus, le délai de réponse très court, inférieur à deux heures, rend le test précieux pour un diagnostic rapide des infections intestinales et optimise l'orientation thérapeutique.