Development of a Geographic Filter for PubMed to Identify Studies Performed in Spain

Introduction and objectivesThe increasing size of the PubMed (Medline) database has made it necessary to develop specific tools for information retrieval (i.e., filters). The current configuration of the Limits option in PubMed does not enable searches to be limited according to geographic criteria. Our objectives, therefore, were a) to develop a geographic filter for the retrieval from PubMed of studies performed in the Spanish population, and b) to assess its performance.MethodsA second-generation filter was constructed by reviewing previous strategies. It involved the selection of three types of record that included: a) the term Spain in different languages; b) Spanish place names (i.e., mainly those of autonomous regions and provinces), and c) acronyms for health services in autonomous regions. The performance of the filter (i.e., its sensitivity and specificity) was assessed in a convenience sample (i.e., clinical trials indexed in PubMed under the MeSH term Myocardial Infarction) by comparison with the results of a manual search (the gold standard). In addition, the filter's performance was also evaluated by comparing it with a simple search for the term Spain[ad].ResultsUse of the filter retrieved 74 (98.7%) of the relevant references. The sensitivity (88.1%) was higher than that of the simple search strategy (45.8%), and excellent specificity (100%) was achieved in both cases.ConclusionsAn efficient geographic filter has been developed for identifying studies in PubMed that involve the Spanish population.

Introducción y objetivosEl volumen de PubMed (Medline) hace necesarias herramientas específicas para la recuperación de información (filtros). La actual configuración de la opción «Limits» en PubMed no permite restringir las búsquedas según criterios geográficos. Por ello, se plantearon como objetivos: a) la construcción de un filtro geográfico para la recuperación en PubMed de estudios realizados en la población española, y b)la evaluación de su rendimiento.MétodosSe ha construido un filtro de segunda generación, basado en la revisión de estrategias previas, para la selección de 3 bloques: a)el término «España» y sus variantes en diversos idiomas; b) otros topónimos correspondientes principalmente a comunidades autónomas y provincias, y c) acrónimos correspondientes a los servicios autonómicos de salud. Se evaluó el rendimiento del filtro (sensibilidad y especificidad) en una muestra de conveniencia (ensayos clínicos indizados en PubMed bajo el término MeSH «Myocardial Infarction»), para lo cual se tomó como patrón de referencia la revisión manual de las referencias. También se comparó el rendimiento del filtro con el de la búsqueda simple «spain[ad]».ResultadosEl filtro ha recuperado 74 (98,7%) de las referencias pertinentes y ha demostrado una sensibilidad (88,1%) muy superior a la de la búsqueda simple (45,8%), alcanzándose una especificidad excelente en uno y otro caso (100%).ConclusionesSe dispone de un filtro eficiente para la identificación de estudios realizados en población española en PubMed.