Towards a standard for Aspergillus PCR - requirements, process and results

The diagnosis of invasive fungal disease remains challenging. The development of the European Organization for Research and Treatment of Cancer/Mycoses Study Group criteria has helped standardise diagnosis, yet PCR is excluded, a result of limited standardisation and concurrent clinical validation. In 2006, the European Aspergillus PCR Initiative working party of International Society of Human and Animal Mycoses was formed with the aim of establishing a standard for PCR methodology for the diagnosis of invasive aspergillosis, to attain an accurate clinical utility of PCR and acceptance of PCR in future disease defining criteria. This manuscript will provide an overview of the standardisation process, before describing the potential samples available and the reasoning behind the choices made. It will summarise the key findings, provide the European Aspergillus PCR Initiative recommendations when testing whole blood and serum, and conclude with a synopsis of future European Aspergillus PCR Initiative perspectives and other key processes that will improve PCR based diagnosis.

ResumenEl diagnóstico de la enfermedad fúngica invasora sigue siendo un reto. El desarrollo de los criterios del grupo de trabajo de la European Organization for Research and Treatment of Cancer/ Mycoses han ayudado a estandarizar el diagnóstico, sin embargo, la prueba de PCR (reacción en cadena de la polimerasa) se excluye por su limitada estandarización y su concurrente validación clínica. En 2006, se formó la Iniciativa Europea Aspergillus-PCR, un grupo de trabajo de la International Society of Human and Animal Mycoses que tenía como objetivo establecer una metodología estándar de la PCR para el diagnóstico de la aspergilosis invasora y conseguir la utilidad clínica precisa de esta prueba para definir los criterios de la enfermedad. Este estudio ofrece una visión general del proceso de estandarización, describe las posibles muestras disponibles y el razonamiento en el que se basaron las decisiones tomadas. Resume las principales conclusiones, ofrece las recomendaciones de la Iniciativa Europea de Aspergillus PCR en el análisis de de la sangre total y el suero, y concluye con una sinopsis de las futuras perspectivas europeas de la iniciativa Aspergillus y los otros procesos clave que mejorarán el diagnóstico basado en PCR.