Phylogenetic analysis of hemagglutinin, neuraminidase, and nucleoprotein genes of H9N2 avian influenza viruses isolated in Israel during the 2000–2005 epizootic

The first two isolates of H9N2 influenza virus in Israel were collected from turkey and chicken hosts in May 2000. The actual epizootic of the H9N2 virus started in December 2001, after a 1.5-year period of silence, and still continues. A total of more than 500 isolations from turkeys and chickens were registered during the outbreaks. The present study has revealed some genetic peculiarities among the local isolates, namely: all the isolates belong to the same G1-like phylogenetic lineage, within which they form a single group, which, in turn, is divided into three subgroups in the cases of the HA and NP genes, and two subgroups in the case of the NA gene. The results present a basis for suggesting the existence of two parallel evolutionary trends originating from the same local “prototype” isolate.

RésuméEn Israël, les deux premiers isolats du virus Influenza aviaire H9N2 ont été isolés chez des dindes et des poulets en mai 2000. Apres un an et demi de silence, en décembre 2001, l’actuelle épizootie due au virus H9N2 a commencé et sévie toujours. Au total, plus de 500 virus ont été isolés chez des dindes et des poulets. La présente étude révèle certaines particularités de ces isolats, en particulier: tous appartiennent à la même lignée (G1-similaire). Au sein de cette lignée, ils font tous partis d’un seul groupe qui est lui-même subdivisé en trois sous-groupes pour ce qui est des gènes de l’hémagglutinine (HA) et de la nucléoprotéine (NP) et en deux sous-groupes pour le gène de la neuraminidase (NA). Ces résultats suggèrent l’existence d’une évolution parallèle des virus à partir d‘un même prototype.