Pathogenic ‘Bison-type’ Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis genotype characterized from riverine buffalo (Bubalus bubalis) in North India

Despite low per-animal productivity of ruminants in developing countries, Johne's disease has not been investigated in buffaloes, which are primarily found in these countries. This is due to lack of expertise, diagnostic kits and priority to production diseases like Johne's disease. Presence of pathogenic Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (Map) was investigated by screening of target tissues (mesenteric lymph nodes and large intestine) by culture and IS 900 PCR, in 50 sacrificed buffaloes. Indigenous ELISA kit originally developed for goats and sheep was standardized in buffaloes and used to estimate sero-presence of Map in 167 serum samples representing population of buffaloes in Agra region of North India. In culture, 48.0% buffaloes were positive from 50 tissues each from mesenteric lymph nodes (34.0%) and large intestine (36.0%). IS 900 PCR was standardized using specific primers (150 C and 921) and 229 bp-amplified product was characteristic for Map. Of the 25 mesenteric lymph nodes, 40.0% were positive in IS 900 PCR. Genomic DNA from Map cultures was successfully amplified from all the 24 isolates (100.0%). Map was further genotyped as ‘Bison type’ using IS 1311 PCR–REA. Culture of tissues showed high presence of Map in target tissues, despite high culling rate in buffalos in view of high demand of buffalo meat. Specific tissue-PCR provided rapid confirmation of Map infection in sacrificed buffaloes. In tissue-PCR, all the cultures were positive as compared to 40.0% detected directly from tissues. ELISA kit using indigenous protoplasmic antigen was highly sensitive as compared to commercial antigen in detecting Map infection therefore, could be used as ‘Herd Screening Test’ in buffaloes against Johne's disease. This pilot study first time reports a highly pathogenic ‘Bison-type’ genotype of M. avium subspecies paratuberculosis from the riverine buffaloes (Bubalus bubalis) of Agra region in North India.

RésuméMalgré la productivité par-animal basse de ruminants dans les pays en développement, la maladie de Johne n'a pas été enquêté dans buffaloes, qui sont essentiellement trouvés dans ces pays. C'est en raison du manque d'expertise, kits diagnostiques et priorité des maladies de production comme La maladie de Johne. La présence de Mycobacterium pathogénique avium la paratuberculose de sous-espèces (La carte) a été enquêtée en cachant des tissus prévus (mesenteric les noeuds de lymphe et grand l'intestin) par la culture et EST 900 PCR, dans 50 a sacrifié buffaloes. Kit ELISA indigene à l'origine développé pour les chèvres et les moutons a été standardisé dans buffaloes et utilisé pour estimer la sero-présence de Carte dans 167 échantillons de sérum la population représentante de buffaloes dans Agra région de l'Inde Nord. Dans la culture, 48.0% buffaloes étaient positifs de 50 tissus chacun de les noeuds de lymphe de mesenteric (34.0%) et gros intestin (36.0%). EST 900 PCR a été standardisé en utilisant des abécédaires spécifiques (150 C et 921) et 229 produit bp-amplified était caractéristique pour la Carte. Des 25 noeuds de lymphe mesenteric, 40.0% étaient positifs dans EST 900 PCR. L'ADN de Genomic des cultures de Carte a été avec succès amplifié de tous les 24 isole (100.0%). La carte était davantage genotyped comme ‘utilisation’ de type de Bison EST 1311 PCR–REA. La culture de tissus a montré la haute présence de Carte dans les tissus prévus, malgré le fait de choisir haut le taux à bufflesses en vue de la haute demande de viande de bufflesse. Le tissu-PCR spécifique a fourni la confirmation rapide d'infection de Carte dans buffaloes sacrifié. Dans le tissu-PCR, toutes les cultures étaient positives en comparaison de 40.0% découverts directement des tissus. Le kit d'ELISA en utilisant l'antigène protoplasmic indigène était hautement sensible en comparaison de l'antigène commercial dans le fait de découvrir l'infection de Carte donc, pourrait être utilisé comme ‘le Troupeau Cachant l'Épreuve’ dans buffaloes contre la maladie de Johne. Cette étude pilote première fois annonce un génotype 'de Type de bison' extrêmement pathogénique de M. avium la paratuberculose de sous-espèces de buffaloes riverain (Bubalus bubalis) de la région Agra dans l'Inde Nord.