Genetic analyses of two spawning stocks of the short-finned squid (Illex argentinus) using nuclear and mitochondrial data

Short-finned squid Illex argentinus (Omastrephidae) is an economically important species which supports a long-term and intensive commercial fishery in the South-West Atlantic Ocean. In this study, the genetic variability of allozymes (40 loci) and mitochondrial regions, COI (556 bp) and 16S rDNA (439 bp), were addressed in the two most important species’ spawning stocks, the Summer Spawning Stock (SSS) and the South Patagonic Stock (SPS). Five out of 20 polymorphic allozyme loci were polymorphic at 95% criterion and heterozygosity levels were low. The concatenated analysis of mitochondrial molecular markers revealed high to low values of haplotype and nucleotide diversity, respectively. Nuclear and mitochondrial data revealed no significant genetic differences between these two spawning stocks. Our results and the biological characteristics of I. argentinus deal with a no simple genetic structure of populations described as spatial and temporal chaotic patchiness. SSS and SPS spawning stocks of I. argentinus could not be elevated to the status of genetic stocks.

RésuméLe calmar Illex argentinus (Omastrephidae) est une espèce économiquement importante, qui donne lieu à une pêche commerciale intense et de longue durée dans le Sud-Ouest de l’océan Atlantique. Dans ce travail, nous avons étudié la variabilité génétique au travers de l’allozyme (40 loci) et de deux régions mitochondriales (COI (556 bp) et 16S rDNA (439 bp)), dans les deux plus importants stocks reproducteurs, le Summer Spawning Stock (SSS) et le South Patagonic Stock (SPS). Des 20 loci allozymique polymorphiques 5 étaient au 95 % et le taux d’hétérozygotie observé était bas. L’analyse concaténée des deux marqueurs moléculaires mitochondriaux a révélé une diversité haplotypique élevée et une diversité nucléotidique basse. Les données nucléaires et mitochondriales ne révèlent pas de différences génétiques entre les deux stocks reproducteurs, peut-être en raison de la dynamique particulaire de chacun, dont les caractéristiques écologiques et reproductives. Les SSS et SPS stocks reproducteurs de calmar I. argentinus ne peuvent pas être élevés au niveau des stocks génétiques.