The anatomy of an aphid genome: From sequence to biology

In 2009, the genome of the pea aphid (Acyrthosiphon pisum) was sequenced and partially annotated. This means that the scientific community has now access to the genetic material of aphids that are serious pests of plants. The description of an aphid genome is a first step to go deeper in the understanding of the biology of these insects. In this article, we first describe how the pea aphid genome has been sequenced and its major characteristics. However, a genome is only a part of what an individual is and describing a genome without taking into account the role of the environment makes no sense. Thus, in the second part of the review, we envisage how this genomic resource will fuel many other disciplines such as ecology, evolutionary biology, population genetics and symbiosis.

RésuméLe génome du puceron du pois (Acyrthosiphon pisum) a été séquencé et partiellement annoté en 2009. La communauté scientifique a donc accès à la description du matériel génétique de pucerons qui sont des ravageurs des plantes. Cette description est une première étape indispensable pour améliorer nos connaissances sur la biologie de ces insectes. Dans une première partie, nous décrivons comment ce génome a été obtenu ainsi que ses principales caractéristiques. Cependant, un génome n’est qu’une composante partielle de ce qui forme un individu et décrire un génome sans tenir compte de l’environnement local n’aurait pas de sens. Aussi, dans une seconde partie, nous proposons des pistes sur l’utilisation de ces données génomiques dans différentes disciplines comme l’écologie, la biologie évolutive, la génétique des populations et les interactions symbiotiques.