The human gut microbiome impacts health and disease

Le microbiote intestinal humain peut maintenant être caractérisé en détail par une approche basée sur le séquençage à haut débit de l'ADN total des selles, que nous appelons métagénomique quantitative. Le cœur de l'approche est un catalogue qui répertorie tous les gènes des microbes intestinaux qui sont connus - 9,9 millions, identifiés par l'analyse de 1267 échantillons de selles. Au-delà de la liste des gènes, les unités génétiques qui les portent commencent à être connues ; beaucoup d'entre elles correspondent à des espèces bactériennes qui n'ont jamais été isolées et encore moins cultivées. La métagénomique quantitative permet de développer des algorithmes puissants pour diagnostiquer une maladie, de surveiller les patients, ainsi que d'identifier les personnes qui présentent un risque de développer une maladie. Cela jette les bases du développement de nouvelles approches pour mieux restaurer et même préserver la santé par modulation d'un microbiote altéré qui contribue à favoriser ou à aggraver une maladie.