Investigation by fluorescence correlation spectroscopy of the chaperoning interactions of HIV-1 nucleocapsid protein with the viral DNA initiation sequences

La protéine de la nucléocapside (NC) de VIH-1 présente des propriétés chaperonnes vis-à-vis des acides nucléiques, qui sont importantes lors de la transcription inverse. Cette étude porte sur l'analyse par spectroscopie à corrélation de fluorescence de l'activité chaperonne de NC vis-à-vis des séquences (−)PBS ADN et (+)PBS ADN impliquées dans le second saut de brin de la transcription inverse. En absence de NC, les tiges boucles PBS présentent une ouverture transitoire limitée à la paire de bases, G-C, terminale. Les cinétiques de cette ouverture transitoire sont activées par NC, ce qui est de nature à stimuler l'hybridation (−)PBS/(+)PBS lors du second saut de brin. En outre, NC induit également la formation de complexes boucle/boucle homologues (−)PBS/(−)PBS et (+)PBS/(+)PBS. Ces complexes peuvent favoriser les contacts secondaires entre les séquences virales et donc la recombinaison et la diversité virale. Pour citer cet article : C. Égelé et al., C. R. Biologies 328 (2005).