کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
1988647 | 1540397 | 2006 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A quantitative method for comparison of expression of alternatively spliced genes using different primer pairs
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
EDCGAPDHqPCRDAFAPPkPCRGPiHprt1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide - 1-اتیل-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimideTAT - تاتTyrosine aminotransferase - تیروزین آمینوترانسفرازAlternative splicing - جابجایی جایگزینquantitative polymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمراز کمیβ-amyloid precursor protein - پروتئین پیش ماده β-آمیلوئیدDecay accelerating factor - کاهش فاکتور شتاب دهندهglyceraldehydes-3-phosphate dehydrogenase - گلیسرالید هیدروژن 3-فسفات دهیدروژنازglycosyl-phosphatidylinositol - گلیکوزیل فسفاتیدیلینوزیتول
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
In this paper we describe a novel two-step method for comparison of expression of alternatively spliced genes by quantitative PCR (QPCR) applying different primer pairs. As a model system we used rat decay accelerating factor (DAF; CD55) mRNA, which comprises three different isoforms: soluble (sDAF), transmembrane (tmDAF) and glycosyl-phosphatidylinositol (GPI) anchored (gpiDAF) forms. The first step was to prepare solid phase specific for each mRNA isoform and purify the three DAF-forms from total RNA. We then assessed amplification efficiency of primer pairs designed to recognise each of the isoforms using equimolar amounts of the three purified DAF mRNAs. The final step in our assay was to compare expression of the three DAF-isoforms in testis by QPCR taking into account the efficiency of their amplification to enable quantification. The RNA capture/QPCR method we described here can be used for quantifying the expression ratios of alternatively spliced mRNAs from a single gene or for direct comparison of expression of different genes.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Biochemical and Biophysical Methods - Volume 66, Issues 1â3, 31 March 2006, Pages 23-31
Journal: Journal of Biochemical and Biophysical Methods - Volume 66, Issues 1â3, 31 March 2006, Pages 23-31
نویسندگان
Rossen M. Donev, B. Paul Morgan,