Genetic diversity and phylogenetic analysis of two Tunisian bivalves (Mactridae) Mactra corallina (Linnaeus, 1758) and Eastonia rugosa (Helbling, 1799) based on COI gene sequences

A partial sequence of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I (COI) was used as a genetic marker for a genetic diversity and phylogenetic analysis (DNA barcoding) of two Mactridae species, Mactra corallina and Eastonia rugosa, collected from the Tunisian coast. These Mactridae species could be distinguished by DNA barcoding techniques and they will be considered as monophyletic clades with the Neighbor-Joining (NJ) tree. The genetic structure detected that E. rugosa presents three haplotypes with a high frequency of HER1 (0.89). However, M. corralina shared 14 haplotypes. The haplotypic diversity (H) was equal to 0.205 and 0.954, respectively, for E. rugosa and M. corallina. While the nucleotide diversity (π) was higher for M. corallina (π = 0.0818), the mismatch distribution showed a unimodal curve for E. rugosa (a recent sudden demographic expansion) and a multimodal distribution for M. corallina (size stability).

RésuméUne séquence partielle du cytochrome c oxydase mitochondriale (COI) a été utilisée comme un marqueur génétique pour une étude de la diversité génétique et une analyse phylogénétique (DNA barcoding) de deux espèces de Mactridae, Mactra corallina et Eastonia rugosa, récoltées le long des côtes tunisiennes. Ces deux espèces de Mactridae pouvaient être identifiées par les techniques de DNA barcoding, et elles seront représentées dans des clades monophylétiques au niveau de l’arbre Neighbor-Joining (NJ). La structure génétique a révélé qu’E. rugosa présente trois haplotypes, avec une fréquence élevée d’HER1 (0,89). Cependant, M. corralina montre 14 haplotypes. La diversité haplotypique (H) est égale à 0,205 et 0,954, respectivement, pour E. rugosa et M. corallina. Alors que la diversité nucléotidique (π) est plus élevée chez M. corallina (π = 0,0818), la répartition des non-concordances montre une courbe unimodale pour E. rugosa (une expansion démographique soudaine et récente) et une distribution multimodale pour M. corallina (stabilité de taille).