Phylogenetic identification of Nocardia brasiliensis strains isolated from actinomycetoma in Mexico State using species-specific primers

SummaryObjectiveThe aim of our research was to update the situation concerning actinomycetoma in Mexico, to localize areas where it is frequently found and to identify the main strains from the isolates.Material and methodsTo localize cases of actinomycetoma, patients’ medical records from the dermatology departments of general and private hospitals were reviewed. Pathologic strains were looked for in general hospital patients and in reference institutes in Mexico City. The clinical strains were kept in Bennett agar and were subsequently identified using polyphasic approaches, including a partial sequence of 16S rDNA using species-specific primers designed to recognise Nocardia species.ResultsEleven cases of actinomycetoma and five species of pathological strains were identified. Most cases were found in south-eastern Mexico and Nocardia brasiliensis was the most frequently isolated species.ConclusionsThis research confirmed the presence of actinomycetoma in Mexico as well as the zones of high incidence and the most frequent pathological strain.

RésuméObjectifL’objectif de notre recherche était de connaître la situation actuelle des actinomycétomes au Mexique, identifier dans quelles régions du Mexique la maladie est plus fréquente et déterminer l’espèce dominante isolée dans les cas trouvés.Matériel et méthodesPour répertorier les cas d’actinomycétome, nous avons revu les dossiers des services de dermatologie des hôpitaux publics et privés du Mexique. Nous avons fait aussi une recherche des souches cliniques dans les hôpitaux généraux et instituts de référence de la ville de Mexico. Les souches cliniques ont été maintenues sur agar Bennett et identifiées par une approche polyphasique y compris l’étude d’une séquence de l’ADNr 16S en utilisant des amorces spécifiques d’espèce pour les Nocardia.RésultatsCette recherche a permis de trouver 11 cas d’actinomycétome, dont nous avons obtenu cinq souches cliniques qui ont été identifiées au niveau de l’espèce. La plupart des cas d’actinomycétome ont été trouvés dans la région sud-est du Mexique. L’espèce isolée dans ces cas a été identifiée à Nocardia brasiliensis.ConclusionCette recherche confirme la présence de cas d’actinomycétome au Mexique dans des régions de majeure incidence et montre que Nocardia brasiliensis est l’espèce dominante dans les cas trouvés.