کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
3377683 1407938 2016 4 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism method for differentiation of uropathogenic specific protein gene types
ترجمه فارسی عنوان
روش پلی‌مورفیسم طول قطعه واکنش محدود زنجیره پلیمریزا برای تمایز انواع ژن پروتئین خاص
کلمات کلیدی
جزیره پاتوژنیک؛ پلی مورفیسم طول قطعه واکنش محدود ؛ عفونت مجاری ادراری؛ اشرشیا کولی اوروپاتوژنیک؛ پروتئین اختصاصی اوروپاتوژنیک
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری ایمنی شناسی و میکروب شناسی ایمونولوژی
چکیده انگلیسی

The putative pathogenicity island (PAI) containing the uropathogenic specific protein (usp) gene and three small open reading frames (orfU1, orfU2, and orfU3) encoding 98, 97, and 96 amino acid proteins is widely distributed among uropathogenic Escherichia coli (UPEC) strains. This PAI was designated as PAIusp. Sequencing analysis of PAIusp has revealed that the usp gene can be divided into two types – uspI and uspII – based on sequence variation at the 3′ terminal region and the number and position of orfUs differ from strain to strain. Based on usp gene types and orfU sequential patterns, PAIusp can be divided into four subtypes. Subtyping of PAIusp is a useful method to characterize UPEC strains. In this study, we developed a polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method to differentiate usp gene types. This method could correctly identify the usp gene type in usp-positive UPEC strains in our laboratory.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Microbiology, Immunology and Infection - Volume 49, Issue 4, August 2016, Pages 591–594
نویسندگان
, , , ,