Molecular characterization of Staphylococcus aureus isolated from humans related to a livestock farm in Spain, with detection of MRSA-CC130 carrying mecC gene: A zoonotic case?

ObjectivesTo conduct a study of Staphylococcus aureus carriage in members of a livestock-farmer's family with different degrees of animal contact, and to characterize the recovered isolates.MethodsNasal samples from 11 members of the family were taken in three sampling periods (every six months) (n = 31), and 9 skin samples from superficial lesions were also obtained in 5 of them. Samples were analyzed for S. aureus susceptible (MSSA) and resistant to methicillin (MRSA). S. aureus isolates were tested for antibiotic-resistance phenotype and genotype and for the detection of virulence and IEC-system genes. Molecular typing of isolates was also performed (spa- and multilocus-sequence typing).ResultsEighteen S. aureus isolates were recovered (1 MRSA and 17 MSSA) in the 40 samples analyzed. S. aureus was detected in nasal and skin samples of 7/11 and 4/5 of tested humans, respectively. The MRSA strain was detected in the skin lesion of a farmer with high animal contact, and carried the mecC gene, and was typed as ST130-CC130-t843. The 17 MSSA isolates were ascribed to 9 different spa-types and sequence types included in the clonal complexes CC22, CC30, CC45, CC121, and in the livestock-associated lineages CC9 and CC133. Six strains harbored eta or tsst-1 genes. Three of 18 strains lacked the immune-evasion-cluster (IEC) genes (MRSA-ST130, MSSA-ST1333, and MSSA-ST133), and the remaining isolates were ascribed to IEC type-A or -B.ConclusionsAnimal-associated S. aureus lineages were detected in samples of the farmer's family, highlighting the detection of MSSA-CC133 and mecC-MRSA-ST130.

ResumenObjetivoEstudiar la presencia de S. aureus en muestras nasales y cutáneas de los miembros de una familia de granjeros, con distinto nivel de contacto con ganado, y caracterizar los aislados obtenidos.MétodosSe recogieron 3 muestras nasales (1 cada 6 meses) de los 11 miembros de la familia de granjeros (n = 31) y 9 muestras cutáneas de pequeñas lesiones de 5 de ellos, para aislamiento de S. aureus, tanto sensible (SASM) como resistente a meticilina (SARM). Se realizó la caracterización molecular de los aislados (spa- y multi-locus-sequence-typing) y se estudiaron sus fenotipos y genotipos de resistencia, y su contenido en genes de virulencia y del clúster de evasión-inmune-humano (IEC).ResultadosSe obtuvieron 18 aislados de S. aureus (1 SARM y 17 SASM) en las 40 muestras estudiadas. De las personas examinadas, 9/11 fueron portadoras de S. aureus: 7/11 en muestras nasales y 4/5 en cutáneas. La cepa SARM fue aislada en una lesión cutánea de un granjero, portaba el gen mecC y se tipó como ST130-CC130-t843. En las 17 cepas SASM se detectaron 9 tipos de spa y 9 secuencias-tipo, adscritas a los complejos clonales CC2, CC30, CC45, CC121 y a los asociados con ganado CC9 y CC133. Seis cepas portaron los genes eta o tsst-1. Tres de las 18 cepas carecían de los genes del sistema de evasión inmune (IEC) (SARM-ST130, SASM-ST1333 y SASM-ST133), y el resto presentaron IEC-A o -B.ConclusiónSe detectaron líneas genéticas de S. aureus asociadas a animales en la familia de granjeros, destacando la detección de SASM-CC133 y SARM-ST130-mecC.