Environmental sampling of Ceratonia siliqua (carob) trees in Spain reveals the presence of the rare Cryptococcus gattii genotype AFLP7/VGIV

BackgroundCryptococcus gattii is a pathogenic basidiomycetous yeast that is emerging in temperate climate zones worldwide. C. gattii has repetitively been isolated from numerous tree species. Ongoing environmental sampling and molecular characterization is essential to understand the presence of this primary pathogenic microorganism in the Mediterranean environment.AimsTo report the first isolation of the rare C. gattii genotype AFLP7/VGIV from the environment in Europe.MethodsSamples were collected from woody debris of carob trees (Ceratonia siliqua) and olive trees (Olea europaea) in El Perelló, Tarragona, Spain. Cryptococcus species were further characterized by using URA5-RFLP, MALDI-TOF, AFLP and MLST. The antifungal susceptibility profile to amphotericin B, 5-fluorocytosine, fluconazole, itraconazole, posaconazole and voriconazole was determined using Sensititre Yeast One and E-test.ResultsCultures from one carob tree revealed the presence of ten Cryptococcus-like colonies. One colony was identified as C. gattii, and subsequent molecular characterization showed that it was an α mating-type that belonged to the rare genotype AFLP7/VGIV. Antifungal susceptibility testing showed values within the range of sensitivity described for other isolates of the same genotype and within the epidemiological cutoff values for this species.ConclusionsThe isolation of the rare C. gattii genotype AFLP7/VGIV in Spain is the first report in the European environment, implying the possible presence in other regions of the Mediterranean area, and underlines that clinicians must be aware for C. gattii infections in healthy individuals.

ResumenAntecedentesCryptococcus gattii es una levadura perteneciente a los basidiomicetos y considerada un patógeno emergente en climas templados. C. gattii se ha aislado en un gran número de especies de árboles en todo el mundo. El muestreo medioambiental y la caracterización molecular de C. gattii es esencial para entender la presencia de este patógeno primario en el entorno de la cuenca mediterránea.ObjetivosComunicar la presencia del raro genotipo AFLP7/VGIV de C. gattii en el medioambiente en Europa.MétodosSe tomaron muestras de detritus de algarrobos (Ceratonia siliqua) y olivos (Olea europaea) en las afueras de El Perelló (Tarragona, España). La colonia de C. gattii aislada se sometió a análisis mediante URA5-RFLP, MALDI-TOF, AFLP y MLST. Se llevó a cabo un estudio de sensibilidad in vitro a la anfotericina B, 5-fluorocitosina, fluconazol, itraconazol, posaconazol y voriconazol mediante las pruebas comerciales Sensititre Yeast One® y E-test®.ResultadosDe una de las muestras de un algarrobo se aislaron 10 colonias susceptibles de ser Cryptococcus. Una de ellas fue estudiada e identificada como C. gattii, y su subsecuente caracterización molecular mostró que se trataba de un tipo sexual α y que pertenecía al raro genotipo AFLP7/VGIV. El estudio de la sensibilidad a los antifúngicos mostró valores similares a los de otras cepas del mismo genotipo y dentro del rango de valores de corte epidemiológicos para la especie.ConclusionesEl aislamiento en España de C. gattii con el genotipo AFLP7/VGIV es el primero descrito en el medioambiente en Europa; podría encontrarse también en otros países de la cuenca mediterránea, donde debería tenerse un especial cuidado por la posibilidad de infección en individuos no inmunodeprimidos.