کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5907635 | 1569919 | 2008 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Identification of the minimal promoter region of the mouse NKX5-3, a transcription factor implicated in eye development
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
PBSMUTAP-2ChrSV40Activator protein 2TBSTFBSDTToligodeoxyribonucleotideTSSTransactivation assayDMEMcDNA - cDNADNA complementary to RNA - DNA مکمل RNADulbecco's modified Eagle's medium - Medal of Eagle اصلاح شده DulbeccoSp1 - SP1Electrophoretic mobility shift assay - آزمون تحرک تحرک الکتروفورزEDTA - اتیلن دی آمین تترا استیک اسید EST - استethylenediamine tetraacetic acid - اسید اتیلنیدین تتراستیکoligo - الیگوTris-buffered saline - تریس بافر شورExpressed Sequence Tag - تکرار اظهار نظرbase pair - جفت پایهmutated - جهش یافتهdithiothreitol - دیتیوتریتولtranscription start site - رونویسی شروع سایتtranscription factor binding site - سایت اتصال فاکتور رونویسیEMSA یا electrophoretic mobility shift assay - سنجش تغییر تحرک الکتروفورتیکSp1 transcription factor - فاکتور رونویسی Sp1Phosphate-buffered saline - محلول نمک فسفات با خاصیت بافریSpecificity protein 1 - مشخصات پروتئین 1UTR یا untranslated regions - منطقه ترجمه نشدهuntranslated region - منطقه غیر ترجمهwild type - نوع وحشیNucleotide - نوکلئوتیدpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازSimian virus 40 - ویروس سیمانی 40TATA-less promoter - پروتئین کمتر TATACHiP - چیپChromosome - کروموزم
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Early ocular development is controlled by a complex network of transcription factors, cell cycle regulators, and diffusible signalling molecules. Together, these molecules regulate cell proliferation and apoptosis, and specify retinal fate. NKX5-3 is a homeobox transcription factor implicated in eye development. The analysis of the 5'-flanking region of the mouse Nkx5-3 gene revealed a predicted TATA-less promoter sequence between â 416 and â 166 of the translation start site. To functionally characterise Nkx5-3 promoter activity, serial deletions of the promoter sequence were introduced in pGL-3 basic vector and promoter activity of these 5'- and 3'-deleted constructions was tested in HeLa and CHO cells. Transactivation assays identified a region between â 350 and â 296 exhibiting promoter-like activity. Combined analysis by deletions and point mutations showed that this sequence, containing multiple Sp1 binding sites was necessary to promote transcriptional activity. Binding of Sp1 to this region was confirmed by electrophoretic mobility shift assay (EMSA) and chromatin immunoprecipitation, using an antibody specific for Sp1. Altogether, these results demonstrated that the immediate upstream region of Nkx5-3 gene possessed a strong intrinsic promoter activity in vitro, suggesting a potential role in Nkx5-3 transcription in vivo.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 411, Issues 1â2, 31 March 2008, Pages 10-18
Journal: Gene - Volume 411, Issues 1â2, 31 March 2008, Pages 10-18
نویسندگان
Olivia Nichini, Daniel F. Schorderet,