کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5908880 | 1570170 | 2015 | 8 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A novel baseline hepatitis B virus sequencing-based strategy for predicting adefovir antiviral response
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
viral responseAdVUDPSnucleoside/nucleotide analoguesTBVHDVCHBSDSORFsETVNASALTROCTDFAUC - AUCHCC - HCCadefovir dipivoxil - آدفوویر دوپیفوکسیلAST - آسپارتات ترانس آمینازAlanine aminotransferase - آلانین آمینوترانسفرازShannon entropy - آنتروپی شانونstandard deviations - انحراف معیارEntecavir - انکاویرReverse transcriptase - ترانس کریپتاز معکوس یا وارونویسtelbivudine - تلبیوودینTenofovir - تنفوویرRandom forest - جنگلهای تصادفی یا جنگلهای تصمیم تصادفیAntiviral therapy - درمان ضد ویروسیbody mass index - شاخص توده بدنBMI - شاخص توده بدنیOpen reading frames - فریم های خواندن را باز کنیدLAM - لامLamivudine - لامیوودینSVM - ماشین بردار پشتیبانیSupport vector machine - ماشین بردار پشتیبانیnegative predictive values - مقادیر پیش بینی منفیPositive predictive values - مقادیر پیش بینی کننده مثبتarea under the curve - منطقه تحت منحنیchronic hepatitis B - هپاتیت B مزمن، هپاتیت ب مزمنHBV - هپاتیت بHepatitis C virus - هپاتیت سیHCV - هپاتیت سیpolymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمرازPCR - واکنش زنجیرهٔ پلیمرازHIV - ویروس نقص ایمنی انسانی human immunodeficiency virus - ویروس نقص ایمنی انسانیHepatitis B virus (HBV) - ویروس هپاتیت B (HBV)Hepatitis D virus - ویروس هپاتیت Dhepatitis B virus - ویروس هپاتیت بیUltra-deep pyrosequencing - پیروتجزیه فوق العاده عمیقHepatocellular carcinoma - کارسینوم هپاتوسلولار(کارسینوم سلولهای استخوانی)receiver operating characteristic - گیرنده عامل عامل
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
بوم شناسی، تکامل، رفتار و سامانه شناسی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Adefovir dipivoxil (ADV) is used as first-line monotherapy or rescue therapy in chronic hepatitis B (CHB) patients. In this study, we sought to identify nucleotide changes in the reverse transcriptase (RT) of hepatitis B virus (HBV) at baseline and explore their predictive value for ADV antiviral response. Ultra-deep pyrosequencing (UDPS) was utilized to determine HBV genetic variability within the RT region at baseline and during a 48-week ADV therapy. According to the viral load at the end of ADV treatment, all patients were classified into responders (HBV DNA level reduction of ⩾3 log 10 IU/mL) and suboptimal responders (HBV DNA level reduction of <3 log 10 IU/mL). Based on UDPS data at baseline, we identified 11 nucleotide substitutions whose combination frequency was significantly associated with the antiviral response among 36 CHB patients in the study group. However, the baseline distribution and frequency of rt181 and rt236 substitutions known to confer ADV resistance was a poor predictor for the antiviral response. Compared with baseline serum HBeAg, HBV-DNA and ALT levels, the baseline HBV sequence-based model showed higher predictive accuracy for ADV response. In an independent cohort of 31 validation patients with CHB, the sequence-based model provided greater predictive potency than the HBeAg/HBV-DNA/ALT and the HBeAg/HBV-DNA/ALT/sequence combinations. Taken together, we confirm the presence of ADV resistance variants in treatment-naïve patients and firstly unravel the predictive value of the baseline mutations in the HBV RT region for ADV antiviral response.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Infection, Genetics and Evolution - Volume 33, July 2015, Pages 269-276
Journal: Infection, Genetics and Evolution - Volume 33, July 2015, Pages 269-276
نویسندگان
Yu-Wei Wang, Xuefeng Shan, Yao Huang, Haijun Deng, Wen-Xiang Huang, Da-Zhi Zhang, Juan Chen, Ni Tang, You-Lan Shan, Jin-Jun Guo, Ailong Huang,