کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
8356052 1542013 2018 27 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Review: Plant immune signaling from a network perspective
ترجمه فارسی عنوان
بررسی: سیگنالینگ ایمنی بدن از دیدگاه شبکه
ترجمه چکیده
برای زیست شناسی پیش بینی شده از یک شبکه بزرگ و پیچیده، اطلاعات مکانیستی مهم شامل توپولوژی شبکه، قوانین همگرایی سیگنال و دینامیک سیگنال است. در عمل، کلید فعال سازی مدل پیش بینی یک شبکه پیچیده، آن را به اندازه کافی کاهش می دهد تا به مدل سازی اجازه می دهد بدون اینکه عوامل مهمی را که بر رفتار شبکه تاثیر می گذارد را کنار بگذارد. در اینجا من استدلال می کنم که شبکه سیگنالینگ ایمنی گیاهی باید سطح بالایی از انعطاف پذیری و قابلیت تشخیص را بر اساس حقایق اساسی که گیاهان در معرض تضعیف تکاملی نسبت به پاتوژن های میکروبی هستند داشته باشند و پاسخ غیر ضروری ایمنی برای گیاهان بد است. با کاهش بخش متوسط ​​شبکه سیگنالینگ ایمنی به یک شبکه چهار بخش، ما قبلا نشان دادیم که بخش متوسط ​​در واقع سطح بالایی از انعطاف پذیری و قابلیت تشخیص را دارد و از چه استراتژی های سیگنالینگ ویژگی های شبکه ظاهر می شوند. توانایی جامع ایجاد شبکه کاهش یافته، یک رویکرد کاهنده را به یک شبکه ی انعطاف پذیر تبدیل کرد، که برای تشخیص مکانیزم های سیگنالینگ پنهان شده توسط انعطاف پذیری شبکه، بسیار مهم بود. با این وجود، این شبکه چهار بخش ممکن است برای ایجاد یک مدل پیش بینی با قوانین نسبتا ساده از همگرایی سیگنال کاهش یابد و احتمالا نیاز به انحلال برای ایجاد یک مدل شبکه بسیار پیش بینی شده با مجموعه ای از قوانین ساده همگام سازی سیگنال دارد.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک دانش گیاه شناسی
چکیده انگلیسی
For predictive biology of a large and complex network, important mechanistic information consists of network topology, signal-convergence rules, and signal dynamics. In practice, the key to enabling predictive modeling of a complex network is reducing it sufficiently to allow modeling without omitting important factors affecting network behavior. Here I argue that the plant immune signaling network must have high levels of resilience and tunability based on the fundamental facts that plants are evolutionarily disadvantaged relative to microbial pathogens and that unnecessary immune response is bad for plants. By reducing the middle part of the immune signaling network to a four-sector network, we previously showed that the middle part indeed has high levels of resilience and tunability and from what signaling strategies the network properties emerge. The ability to comprehensively reconstitute the reduced network enabled a reductionist approach to a resilient network, which was crucial for revealing signaling mechanisms concealed by network resilience. However, this four-sector network may be reduced too much to make a predictive model with relatively simple signal-convergence rules and probably requires deconvolution to generate a highly predictive network model with a set of simple signal-convergence rules.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Plant Science - Volume 276, November 2018, Pages 14-21
نویسندگان
,