Review: Plant immune signaling from a network perspective

برای زیست شناسی پیش بینی شده از یک شبکه بزرگ و پیچیده، اطلاعات مکانیستی مهم شامل توپولوژی شبکه، قوانین همگرایی سیگنال و دینامیک سیگنال است. در عمل، کلید فعال سازی مدل پیش بینی یک شبکه پیچیده، آن را به اندازه کافی کاهش می دهد تا به مدل سازی اجازه می دهد بدون اینکه عوامل مهمی را که بر رفتار شبکه تاثیر می گذارد را کنار بگذارد. در اینجا من استدلال می کنم که شبکه سیگنالینگ ایمنی گیاهی باید سطح بالایی از انعطاف پذیری و قابلیت تشخیص را بر اساس حقایق اساسی که گیاهان در معرض تضعیف تکاملی نسبت به پاتوژن های میکروبی هستند داشته باشند و پاسخ غیر ضروری ایمنی برای گیاهان بد است. با کاهش بخش متوسط ​​شبکه سیگنالینگ ایمنی به یک شبکه چهار بخش، ما قبلا نشان دادیم که بخش متوسط ​​در واقع سطح بالایی از انعطاف پذیری و قابلیت تشخیص را دارد و از چه استراتژی های سیگنالینگ ویژگی های شبکه ظاهر می شوند. توانایی جامع ایجاد شبکه کاهش یافته، یک رویکرد کاهنده را به یک شبکه ی انعطاف پذیر تبدیل کرد، که برای تشخیص مکانیزم های سیگنالینگ پنهان شده توسط انعطاف پذیری شبکه، بسیار مهم بود. با این وجود، این شبکه چهار بخش ممکن است برای ایجاد یک مدل پیش بینی با قوانین نسبتا ساده از همگرایی سیگنال کاهش یابد و احتمالا نیاز به انحلال برای ایجاد یک مدل شبکه بسیار پیش بینی شده با مجموعه ای از قوانین ساده همگام سازی سیگنال دارد.