کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10748495 | 1050274 | 2016 | 6 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Exploring the membrane fusion mechanism through force-induced disassembly of HIV-1 six-helix bundle
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
RMSDSMDRMSFroot-mean-square deviation - انحراف معیار میانگین ریشهSix-helix bundle - بسته نرم افزاری شش سیگنالInterfacial interaction - تعامل میان فازیMolecular dynamics - دینامیک ملکولی یا پویایی مولکولیSteered Molecular Dynamics - دینامیک مولکولی SteeredMolecular dynamics simulations - شبیه سازی پویایی مولکولیMembrane fusion - فیوژن غشاییroot-mean-square fluctuation - نوسانات متوسط ریشهProtein unfolding - پروتئین در حال ظهور است
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
زیست شیمی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Enveloped virus, such as HIV-1, employs membrane fusion mechanism to invade into host cell. HIV-1 gp41 ectodomain uses six-helix bundle configuration to accomplish this process. Using molecular dynamic simulations, we confirmed the stability of this six-helix bundle by showing high occupancy of hydrogen bonds and hydrophobic interactions. Key residues and interactions important for the bundle integration were characterized by force-induced unfolding simulations of six-helix bundle, exhibiting the collapse order of these groups of interactions. Moreover, our results in some way concerted with a previous theory that the formation of coiled-coil choose a route which involved cooperative interactions between the N-terminal and C-terminal helix.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 473, Issue 4, 13 May 2016, Pages 1185-1190
Journal: Biochemical and Biophysical Research Communications - Volume 473, Issue 4, 13 May 2016, Pages 1185-1190
نویسندگان
Kai Gao, Yong Zhang, Jizhong Lou,