کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
10870868 1074024 2013 7 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Effect of substrate competition in kinetic models of metabolic networks
ترجمه فارسی عنوان
اثر رقابت سوبسترا در مدل های سینتیک شبکه های متابولیک
کلمات کلیدی
رقابت بستر قوانین سرعت سینتیک، مدل سازی، مسیر سوخت و ساز،
ترجمه چکیده
رقابت بستر می تواند در بسیاری از فرآیندهای بیولوژیکی یافت شود، از جمله بیان ژن به انتقال سیگنال و مسیرهای متابولیکی. اگر چه چندین مطالعۀ تجربی و در مطالعات سیلیکا اثرات رقابت سوبستات را در این فرآیندها نشان داده است، به ویژه در رویکردهای مدل سازی، اغلب نادیده گرفته می شود. با استفاده از مدل های اسباب بازی که نمونه های مختلف سناریوهای مسیر متابولیکی را نشان می دهند، نشان می دهد که رقابت سوبسترا می تواند بر پویایی و غلظت حالت پایدار مسیر متابولیک تأثیر بگذارد. ما علاوه بر قوانین نرخی برای رقابت سوبسترا در واکنشهای برگشت پذیر به دست آورده ایم و قوانین نرخ موجود برای رقابت سوبستات را در واکنش های غیرقابل برگشت خلاصه می کنیم.
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری علوم کشاورزی و بیولوژیک دانش گیاه شناسی
چکیده انگلیسی
Substrate competition can be found in many types of biological processes, ranging from gene expression to signal transduction and metabolic pathways. Although several experimental and in silico studies have shown the impact of substrate competition on these processes, it is still often neglected, especially in modelling approaches. Using toy models that exemplify different metabolic pathway scenarios, we show that substrate competition can influence the dynamics and the steady state concentrations of a metabolic pathway. We have additionally derived rate laws for substrate competition in reversible reactions and summarise existing rate laws for substrate competition in irreversible reactions.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: FEBS Letters - Volume 587, Issue 17, 2 September 2013, Pages 2818-2824
نویسندگان
, , , , ,