کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
2079087 | 1545071 | 2016 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A Graph Based Framework to Model Virus Integration Sites
ترجمه فارسی عنوان
یک چارچوب مبتنی بر گراف به سایت های ادغام ویروس مدل
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
ژن درمانی، زیست شناسی سیستم، ژنومیکس، جهش درونی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
بیوتکنولوژی یا زیستفناوری
چکیده انگلیسی
With next generation sequencing thousands of virus and viral vector integration genome targets are now under investigation to uncover specific integration preferences and to define clusters of integration, termed common integration sites (CIS), that may allow to assess gene therapy safety or to detect disease related genomic features such as oncogenes.Here, we addressed the challenge to: 1) define the notion of CIS on graph models, 2) demonstrate that the structure of CIS enters in the category of scale-free networks and 3) show that our network approach analyzes CIS dynamically in an integrated systems biology framework using the Retroviral Transposon Tagged Cancer Gene Database (RTCGD) as a testing dataset.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computational and Structural Biotechnology Journal - Volume 14, 2016, Pages 69–77
Journal: Computational and Structural Biotechnology Journal - Volume 14, 2016, Pages 69–77
نویسندگان
Raffaele Fronza, Alessandro Vasciaveo, Alfredo Benso, Manfred Schmidt,