کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
4965055 | 1447942 | 2016 | 5 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
The R implementation of the CRAN package PATHChange, a tool to study genetic pathway alterations in transcriptomic data
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
- The package performs multi-statistic analysis to detect differentially expressed pathways in transcriptomic data.
- Developed in R available for download from CRAN.
- Tutorial with sample problem application.
Tools that extract phenotype alterations from transcriptomic data are important to improve the interpretation of biological studies. PATHChange is a statistical CRAN package designed to work with data downloaded from the Gene Expression Omnibus database (GEO) to determine differential pathway expression in comparative studies including control samples. In this paper we present details of the structure, implementation and an example of use of the package.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computers in Biology and Medicine - Volume 78, 1 November 2016, Pages 76-80
Journal: Computers in Biology and Medicine - Volume 78, 1 November 2016, Pages 76-80
نویسندگان
Carla A.R.S. Fontoura, Gastone Castellani, José C.M. Mombach,