Molecular characterization of Candida isolates from intensive care unit patients, Krakow, Poland

BackgroundOver the last decades, Candida species have emerged as important pathogens in immunocompromised patients. Nosocomial infections are mainly of endogenous origin. Nevertheless, some cases of exogenous candidiasis have also been reported.AimsThe aim of this study was to evaluate the genetic relatedness between Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis, Candida krusei and Candida kefyr isolates recovered from intensive care unit (ICU) patients.MethodsA total of 132 Candida clinical isolates (62 C. albicans, 40 C. glabrata, 13 C. tropicalis, 11 C. krusei, 6 C. kefyr), obtained from specimens of endotracheal aspirate, urine and blood taken from patients of a tertiary hospital in Poland, were included in the study. Species identification was performed by PCR method and genetic relatedness was assessed by randomly amplified polymorphic DNA assay (RAPD) with five primers.ResultsThe RAPD analysis revealed high genetic diversity among the studied Candida isolates, indicating that most of the strains were from endogenous sources. Only two clonal strains of C. glabrata isolated from different patients were observed, suggesting a possible cross-transmission of these pathogens.ConclusionsOur study confirmed the high discriminatory power of the RAPD assay. This genotyping method can be applied to local epidemiological studies of Candida species.

ResumenAntecedentesEn las últimas décadas, el hongo Candida se ha convertido en un patógeno importante para los pacientes con trastornos del sistema inmune. Las infecciones nosocomiales son fundamentalmente de origen endógeno; sin embargo, también se han documentado algunos casos de candidiasis exógena.ObjetivosEl objetivo del estudio fue evaluar la relación genética entre las cepas de Candida albicans, Candida glabrata, Candida tropicalis, Candida krusei y Candida kefyr aisladas de pacientes en cuidados intensivos.MétodosSe estudiaron 132 aislamientos de Candida (62 C. albicans, 40 C. glabrata, 13 C. tropicalis, 11 C. krusei, 6 C. kefyr) obtenidos de muestras procedentes de aspirado endotraqueal, orina y sangre tomadas de pacientes de un hospital en Polonia. La identificación de las especies se realizó mediante PCR, y el estudio de la relación genética con el método de amplificación aleatoria de ADN polimórfico (RAPD) con cinco oligonucleótidos.ResultadosEl análisis de la amplificación por RAPD mostró una alta diversidad genética entre los aislamientos objeto de estudio, lo que indica que la mayoría de ellos tenían un origen endógeno. Solo se observaron dos cepas clonales de C. glabrata procedentes de diferentes pacientes, lo que evidencia una posible transmisión cruzada de estos patógenos.ConclusionesNuestro estudio confirma el alto poder discriminatorio de la técnica RAPD, lo que validaría este método de genotipificación para el estudio de la epidemiología local de especies de Candida.