کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
6919818 863703 2015 6 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Strategies for non-uniform sampling of molecular dynamics phase space trajectories of relaxation phenomena
ترجمه فارسی عنوان
استراتژی برای نمونه برداری غیر یکنواخت از مسیرهای فیزیکی فیزیک دینامیکی مولکولی پدیده آرامش
کلمات کلیدی
تجزیه و تحلیل سری زمان، نمونه برداری غیر یکنواخت، دینامیک مولکولی، پدیده آرامش امواج شوک، روش ذرات،
ترجمه چکیده
برنامه های نمونه گیری فضایی فضایی فضایی غیر یکنواخت برای تجزیه و تحلیل زمان دامنه شبیه سازی دینامیک مولکولی فرآیند های گذرا به منظور کاهش هزینه های ذخیره سازی داده ها برای ضبط مسیر برای پردازش پس از پردازش و بایگانی دائمی توسعه داده شد. دوره های نمونه گیری به عنوان توابع زمان تعریف می شود به طوری که فاصله بین نقاط نمونه برداری دقیقا یا تقریبا ثابت در دامنه زمان لگاریتمی است. یک برنامه نمونه گیری غیر یکنواخت به تاریخچه یکنواخت نمونه های زمانی از انرژی جنبشی ترجمه شده برای مولکول های تحریک پذیر در یک کریستال اعمال شد. مقایسه مستقیم سابقه زمان نمونه برداری غیر یکنواخت با یکدیگر نشان میدهد که تاریخ زمان غیرمتعارف دقیقا فرآیند آرامسازی را با 93٪ کاهش در هزینه نگهداری داده ها برای شرایط مورد مطالعه تصاحب می کند. پیامدهای آنالیز فرکانس دامنه مورد بحث قرار گرفته است. یک برنامه نمونه برداری برای شبیه سازی امواج شوک حمایت شده ارائه شده است که تقریبا 60٪ کاهش هزینه ذخیره سازی داده ها را فراهم می کند.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه شیمی شیمی تئوریک و عملی
پیش نمایش مقاله
استراتژی برای نمونه برداری غیر یکنواخت از مسیرهای فیزیکی فیزیک دینامیکی مولکولی پدیده آرامش
چکیده انگلیسی
Non-uniform phase space trajectory sampling schedules were developed for time-domain analysis of molecular dynamics simulations of transient processes to reduce the data storage costs to record the trajectory for post-processing and permanent archival. Sampling periods are defined as functions of time such that the spacing between sampled points is either exactly or approximately constant in the logarithmic-time domain. A non-uniform sampling schedule was applied to uniformly sampled time histories of translational kinetic energy for translationally excited molecules in a crystal. Direct comparison of the non-uniformly sampled time history to the uniform one reveals that the non-uniform time history accurately captures the relaxation process with a 93% reduction in data storage cost for the conditions studied. Implications for frequency-domain analysis are discussed. A sampling schedule for simulations of supported shock waves is presented that provides an approximate 60% reduction in data storage cost.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Computer Physics Communications - Volume 196, November 2015, Pages 143-148
نویسندگان
, ,