کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
8892437 | 1628758 | 2018 | 11 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
De novo transcriptome assembly, gene expressions and metabolites for flower color variation of two garden species in Brassicaceae
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
DEGsEGL3PAP2TTG1Pap1GL3glabrous4CLFPKMOPLS-DAMBWbHLHDFRVIPUGTC4HqPCRCHSLBDCHIBrassicaceae - خانواده شب بو شب بوها یا چلیپائیانnuclear magnetic resonance - رزونانس مغناطیسی هستهای4-Coumarate:CoA ligase - 4-کومارات: لیگاز CoAF3′5′H - F3'5'HF3′H - F3'HPCA - PCAAnthocyanins - آنتوسیانین Basic-helix-loop-helix - اسلحه پایه سیلیکونی حلقه ایPrincipal component analysis - تحلیل مولفههای اصلی یا PCATranscriptome - ترانسکریپتومNMR - تشدید مغناطیسی هستهای Flower color - رنگ گلRIN - رینANS - سالanthocyanidin synthase - سنتاز آنتوسیانیدینchalcone synthase - سنتاز چالکونCinnamate-4-hydroxylase - سینامات 4-هیدروکسیلازRNA Integrity Number - شماره یکپارچه RNAMyb - مبینMetabolite - متابولیتGene ontology - هستیشناسی ژنیquantitative polymerase chain reaction - واکنش زنجیره ای پلیمراز کمیDifferentially expressed genes - ژن های متفاوت بیان شده استchalcone isomerase - کلومون ایزومراز
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
علوم کشاورزی و بیولوژیک
دانش باغداری
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
Petal is not only the target for selection by horticulturist to enhance the ornamental value but also a perfect model system for plant metabolome studies. Petals produce a large number of secondary metabolites that provide petals a variety of colors and fragrance to attract pollinators. Here, we studied petal transcriptome and metabolome of two garden species having various color flowers in Brassicaceae, Erysimum cheiri and Matthiola incana. De novo transcriptome assembly and protein homology analysis between two species and those sequenced species in Brassicaceae generally confirmed their known phylogenetic relationships. Identification of differentially expressed genes (DEGs) indicated that homologs of PAP1 in Arabidopsis might be one of the key gene leaded to the red color formation in bronzing petals of E. cheiri compared to the yellow petals. Metabolome analysis revealed significant difference of metabolites existed in petals of two species or with different color and specific anthocyanin accumulated in E. cheiri. Present data sets will be a great enrichment of the genetic information for two species and provide genetic and metabolomic clue for further mechanism analysis of flower color variation.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Scientia Horticulturae - Volume 240, 20 October 2018, Pages 592-602
Journal: Scientia Horticulturae - Volume 240, 20 October 2018, Pages 592-602
نویسندگان
Daozong Chen, Yi Liu, Qi Pan, FengFeng Li, Qinghua Zhang, Xianhong Ge, Zaiyun Li,