کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
9582202 | 1505183 | 2005 | 7 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Effects of the fixed end in single-molecule imaging techniques: A replica-exchange molecular dynamics simulation study
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
شیمی
شیمی تئوریک و عملی
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
A peptide with the sequence Ac-YGKAAAAKAAAAKAAAAKC-amide is studied with replica-exchange molecular dynamics simulations. We performed two different simulations in this study: one with no constraint and the other with one end fixed. The latter condition was introduced in order to understand the effects of fixing one end in single-molecule imaging techniques. We analyzed our simulation results utilizing principal component analysis. The free-energy landscape showed that fixing one end of the peptide limits the motion of the peptide backbone.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Chemical Physics Letters - Volume 414, Issues 4â6, 14 October 2005, Pages 449-455
Journal: Chemical Physics Letters - Volume 414, Issues 4â6, 14 October 2005, Pages 449-455
نویسندگان
Y. Kawashima, Y. Sugita, T. Yoda, Y. Okamoto,