کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10357262 | 867861 | 2005 | 14 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Revisiting and parallelizing SHAKE
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Revisiting and parallelizing SHAKE Revisiting and parallelizing SHAKE](/preview/png/10357262.png)
چکیده انگلیسی
An algorithm is presented for running SHAKE in parallel. SHAKE is a widely used approach to compute molecular dynamics trajectories with constraints. An essential step in SHAKE is the solution of a sparse linear problem of the type Ax = b, where x is a vector of unknowns. Conjugate gradient minimization (that can be done in parallel) replaces the widely used iteration process that is inherently serial. Numerical examples present good load balancing and are limited only by communication time.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 209, Issue 1, 10 October 2005, Pages 193-206
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 209, Issue 1, 10 October 2005, Pages 193-206
نویسندگان
Yael Weinbach, Ron Elber,