کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10357889 | 867921 | 2005 | 17 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Multiscale stochastic simulation algorithm with stochastic partial equilibrium assumption for chemically reacting systems
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
In this paper, we introduce a multiscale stochastic simulation algorithm (MSSA) which makes use of Gillespie's stochastic simulation algorithm (SSA) together with a new stochastic formulation of the partial equilibrium assumption (PEA). This method is much more efficient than SSA alone. It works even with a very small population of fast species. Implementation details are discussed, and an application to the modeling of the heat shock response of E. Coli is presented which demonstrates the excellent efficiency and accuracy obtained with the new method.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 206, Issue 2, 1 July 2005, Pages 395-411
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 206, Issue 2, 1 July 2005, Pages 395-411
نویسندگان
Yang Cao, Dan Gillespie, Linda Petzold,