کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
10358661 | 868613 | 2005 | 17 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Dual-level parallelism for ab initio molecular dynamics: Reaching teraflop performance with the CPMD code
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله

چکیده انگلیسی
We show teraflop performance of the fully featured ab initio molecular dynamics code CPMD on an IBM pSeries 690 cluster. A mixed distributed-memory, coarse-grained parallel approach using the MPI library and shared-memory, fine-grained parallelism using OpenMP directives is used to optimally map the algorithms on the available hardware. The top performance achieved is â20% of the peak performance and an estimated parallel efficiency of â45% on 1024 processors for a system of 1000 atoms. The main limiting factor of parallel efficiency was found to be the latency of the interconnect.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Parallel Computing - Volume 31, Issue 1, January 2005, Pages 1-17
Journal: Parallel Computing - Volume 31, Issue 1, January 2005, Pages 1-17
نویسندگان
Jürg Hutter, Alessandro Curioni,