کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
1869997 1530956 2015 9 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Multi-timestep Integrator for the Modified Andersen Barostat
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه فیزیک و نجوم فیزیک و نجوم (عمومی)
پیش نمایش صفحه اول مقاله
Multi-timestep Integrator for the Modified Andersen Barostat
چکیده انگلیسی

An extension of the multiple time-step integration following Kopf et al. (1997) for the Langevin thermostat and modified Ander- sen barostat is described. Proper isothermal and isobaric properties are validated on a Lennard-Jones liquid and a coarse-grained peptide-lipid model. Measurements of the configurational temperature indicate proper canonical sampling, while folding simu- lations of unstructured peptides into transmembrane helices provide a realistic application and suggest the maximum set of time steps usable for that model.

ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Physics Procedia - Volume 68, 2015, Pages 7-15