کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
4961001 1446507 2017 10 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Facilitating the Reproducibility of Scientific Workflows with Execution Environment Specifications
ترجمه فارسی عنوان
تسهیل تجدید پذیری جریان های علمی با مشخصات محیط اجرایی
کلمات کلیدی
تحقیق قابل تجدید، جریان کار علمی، مشخصات محیط اجرای،
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر علوم کامپیوتر (عمومی)
چکیده انگلیسی
To evaluate our framework, we use it to run two bioinformatics scientific workflows, BLAST and BWA. The execution environment of the tasks in each workflow is specified as an Umbrella specification file, and sent to execution nodes where Umbrella is used to create the specified environment for running the tasks. For each workflow we evaluate the size of the Umbrella specification file, the time and space overheads of creating execution environments using Umbrella, and the heterogeneity of execution nodes contributing to each workflow. The evaluation results show that our framework improves the utilization of heterogeneous computing resources, and improves the portability and reproducibility of scientific workflows.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Procedia Computer Science - Volume 108, 2017, Pages 705-714
نویسندگان
, ,