کد مقاله کد نشریه سال انتشار مقاله انگلیسی نسخه تمام متن
4967248 1449367 2017 13 صفحه PDF دانلود رایگان
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Coupling sample paths to the thermodynamic limit in Monte Carlo estimators with applications to gene expression
ترجمه فارسی عنوان
مسیر نمونه های اتصال به محدودیت ترمودینامیکی در برآوردها مونت کارلو با برنامه های کاربردی به بیان ژن
ترجمه چکیده
بسیاری از سیستم های بیوشیمیایی که در برنامه های کاربردی ظاهر می شوند دارای ساختار چندمرحلهای هستند به طوری که آنها در فرآیند ترمودینامیکی همگرا با فرآیندهای قطعی مکانیکی مارکوف هستند. آمار فرایند قطعی قطعی را می توان بسیار موثر تر از آنچه که در فرآیند دقیق است، بدست آوریم. ما امکان پیوند مسیرهای نمونه مدل دقیق را با فرآیند قطعی قطعی به منظور کاهش واریانس اختلاف آنها بررسی می کنیم. سپس این اتصال را برای کاهش پیچیدگی محاسباتی برآورد کننده مونت کارلو اعمال می کنیم. با توجه به نتایج دقیق در [1]، ما نشان می دهیم که چگونه این روش را می توان به مدل های بیولوژیکی واقع گرایانه با مقیاس های غیر ترسیم اعمال کرد.
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه مهندسی کامپیوتر نرم افزارهای علوم کامپیوتر
چکیده انگلیسی
Many biochemical systems appearing in applications have a multiscale structure so that they converge to piecewise deterministic Markov processes in a thermodynamic limit. The statistics of the piecewise deterministic process can be obtained much more efficiently than those of the exact process. We explore the possibility of coupling sample paths of the exact model to the piecewise deterministic process in order to reduce the variance of their difference. We then apply this coupling to reduce the computational complexity of a Monte Carlo estimator. Motivated by the rigorous results in [1], we show how this method can be applied to realistic biological models with nontrivial scalings.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 346, 1 October 2017, Pages 1-13
نویسندگان
, ,