کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
519201 | 867645 | 2010 | 24 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Discretization errors in molecular dynamics simulations with deterministic and stochastic thermostats
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
We investigate the influence of numerical discretization errors on computed averages in a molecular dynamics simulation of TIP4P liquid water at 300 K coupled to different deterministic (Nosé–Hoover and Nosé–Poincaré) and stochastic (Langevin) thermostats. We propose a couple of simple practical approaches to estimating such errors and taking them into account when computing the averages. We show that it is possible to obtain accurate measurements of various system quantities using step sizes of up to 70% of the stability threshold of the integrator, which for the system of TIP4P liquid water at 300 K corresponds to the step size of about 7 fs.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 229, Issue 24, 10 December 2010, Pages 9323–9346
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 229, Issue 24, 10 December 2010, Pages 9323–9346
نویسندگان
Ruslan L. Davidchack,