کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
520429 | 867718 | 2008 | 13 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
A numerical scheme for optimal transition paths of stochastic chemical kinetic systems
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
We present a new framework for finding the optimal transition paths of metastable stochastic chemical kinetic systems with large system size. The optimal transition paths are identified to be the most probable paths according to the Large Deviation Theory of stochastic processes. Dynamical equations for the optimal transition paths are derived using the variational principle. A modified Minimum Action Method (MAM) is proposed as a numerical scheme to solve the optimal transition paths. Applications to Gene Regulatory Networks such as the toggle switch model and the Lactose Operon Model in Escherichia coli are presented as numerical examples.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 227, Issue 19, 1 October 2008, Pages 8672–8684
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 227, Issue 19, 1 October 2008, Pages 8672–8684
نویسندگان
Di Liu,