کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
522280 | 867819 | 2007 | 13 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Trotter derived algorithms for molecular dynamics with constraints: Velocity Verlet revisited
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
موضوعات مرتبط
مهندسی و علوم پایه
مهندسی کامپیوتر
نرم افزارهای علوم کامپیوتر
پیش نمایش صفحه اول مقاله
چکیده انگلیسی
On the basis of the molecular dynamics algorithm proposed by Kalibaeva et al. [G. Kalibaeva, M. Ferrario, G. Ciccotti, Mol. Phys. 101 (2003) 765.] for systems with holonomic constraints in isobaric–isothermal ensemble, we discuss a new recursive algorithm which eliminates the inconsistency associated with the double calculation of constraint forces present in RATTLE. The algorithm is tested on bulk water and on a system containing a polymer with a large number of constraints to evaluate the CPU gain with respect to the usual RATTLE algorithm.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 222, Issue 1, 1 March 2007, Pages 428–440
Journal: Journal of Computational Physics - Volume 222, Issue 1, 1 March 2007, Pages 428–440
نویسندگان
V. Marry, G. Ciccotti,