Current analysis of host-parasite interactions with a focus on next generation sequencing data

در میان شایع ترین گونه های تعامل بین گونه ها، بین میزبان ها و انگل های آنهاست و پیامدهای مهمی برای نظریه تکاملی دارند. درک فرآیندهای فنوتیپیک و ژنوتیپیک که دربرابر چنین تعاملاتی عمل می کنند، تلاش بزرگی در زیست شناسی است، اما یک کار پیچیده و چالش برانگیز است. توسعه تکنولوژی توالی نسل بعدی به تازگی این زمینه را از دیدگاه مولکولی باز کرده است، به ما امکان دسترسی به داده های ژنومی را که اساس آزمایشگاه یا فنوتیپ های وحشی است، می دهد. داده های به دست آمده از چنین فن آوری ها دارای مزایای فراوانی نسبت به روش های قبلی، از قبیل افزایش فراوانی، اغلب دقیق تر، کار کم کار برای تولید و هزینه تر بودن تولید است. ما یک بررسی راجع به تأثیر داده های توالی نسل بعدی در مورد تکامل میزبان و انگیزه های فعلی که با این داده ها مورد بررسی قرار گرفته اند، ارائه می کنیم. ما بر روی دو نوع داده اصلی، ژنوم و ترانسکتومیک تمرکز می کنیم. ما در مورد رویکردهای محاسباتی محبوب است که می تواند به ما در تشخیص نیروهای مولکولی رانندگان سیستم میزبان انگل کمک کند و برخی مطالعاتی را انجام داده اند که از چنین روش هایی برای کسب اطلاعات در مورد پروتکل های ایمنی خاص استفاده می کنند. علاوه بر این، برخی از دیدگاه های امیدوار کننده از فن آوری های در حال ظهور و جدید که به محققان اجازه می دهد درک عمیق تر این تعاملات را برجسته نمایند، برجسته خواهد شد.