کد مقاله | کد نشریه | سال انتشار | مقاله انگلیسی | نسخه تمام متن |
---|---|---|---|---|
5907214 | 1160003 | 2012 | 9 صفحه PDF | دانلود رایگان |
عنوان انگلیسی مقاله ISI
Computational prediction of the PolyQ and CAG repeat spinocerebellar ataxia network based on sequence identity to untranslated regions
دانلود مقاله + سفارش ترجمه
دانلود مقاله ISI انگلیسی
رایگان برای ایرانیان
کلمات کلیدی
DUSP10calcium/calmodulin-dependent protein kinase II alphaGrin2aRefSeqGNAQATXN3ATXN2CACNA1AEBF1GABRA1TBPCREBBPGRIN1CtBP1Kif5bFRS2HPRDC-terminal binding protein 1CHUKELMO1SCAEphA4CFTRCamk2aGBACAGPolyQATXN1ataxia telangiectasia mutated - Ataxia telangiectasia جهش یافته استIgf1 - IGF1spinocerebellar ataxia - آتاکسی spinocerebellarlong term potentiation - تقویت طولانی مدتLTP - تقویت طولانی مدت یا LTP ATM - خودپردازDAVID - دیویدcystic fibrosis transmembrane conductance regulator - رگولاتور رسانایی فرابنفش فیبروز کیستیکinsulin-like growth factor 1 - فاکتور رشد مانند انسولین 1UTR یا untranslated regions - منطقه ترجمه نشدهuntranslated region - منطقه غیر ترجمهNucleotide - نوکلئوتیدdatabase for annotation, visualization and integrated discovery - پایگاه داده برای حاشیه نویسی، تجسم و کشف یکپارچهHuman Protein Reference Database - پایگاه داده مرجع پروتئین انسانیCREB binding protein - پروتئین اتصال CREBTATA box binding protein - پروتئین اتصال دهنده جعبه TATAAndrogen Receptor - گیرنده آندروژنی
موضوعات مرتبط
علوم زیستی و بیوفناوری
بیوشیمی، ژنتیک و زیست شناسی مولکولی
ژنتیک
پیش نمایش صفحه اول مقاله
![عکس صفحه اول مقاله: Computational prediction of the PolyQ and CAG repeat spinocerebellar ataxia network based on sequence identity to untranslated regions Computational prediction of the PolyQ and CAG repeat spinocerebellar ataxia network based on sequence identity to untranslated regions](/preview/png/5907214.png)
چکیده انگلیسی
Computational prediction of biological networks would be a tremendous asset to systems biology and personalized medicine. In this paper, we use a moving window bioinformatic screen to identify transcripts with partial identity to the 5â² and 3â²UTRs of the polyQ spinocerebellar ataxia (SCA) genes ATXN1, ATXN2, ATXN3, ATXN7, TBP and CACNA1A and the CAG repeat expansion gene PPP2R2B. We find that the bioinformatic screen enriches for transcripts that encode proteins that interact and that have functions relevant to polyQ SCA. Transcription control and RNA binding are the primary functional groups represented in the proteins from the combined screens. The insulin growth factor pathway, the WNT pathway, long term potentiation, melanogenesis and ATM mediated DNA repair pathways were identified as important pathways. UGUUU repeats were identified as an abundant motif in the SCA network and PAXIP1, CELF2, CREBBP, EBF1, PLEKHG4, SRSF4, C5orf42, NFIA, STK24, and YWHAG were identified as statistically significant proteins in the polyQ and PPP2R2B network.
ناشر
Database: Elsevier - ScienceDirect (ساینس دایرکت)
Journal: Gene - Volume 509, Issue 2, 10 November 2012, Pages 273-281
Journal: Gene - Volume 509, Issue 2, 10 November 2012, Pages 273-281
نویسندگان
Jean L. Spence, Scott Wallihan,